Abordagens de genomica comparativa atraves da utilizacao de gsss e sequenciamento do cromossomo 2 de leishmania major.

• Processo: 01/13461-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2002
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2006
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Angela Kaysel Cruz
• Beneficiário: Jeronimo Conceição Ruiz
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 99/12403-3 - Do genoma à biologia de Leishmania: uma abordagem compreensiva, AP.TEM
• Assunto(s): Biologia computacional Genômica comparativa
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bioinformatica | Cromossomo 2 | Genomica Comparativa | Gss | Leishmaniose Major | Tranposon Mariner

Resumo

O presente projeto objetiva analisar comparativamente as seqüências já geradas de L. major Friedlin com as GSSs que serão produzidas a partir do DNA genômico de L. viannia brasiliensis estabelecendo e incorporando todos os recursos de bioinformática necessários para tanto. Inicialmente utilizaremos um piloto de 10.000 GSSs (Eliane Laurentino 00/10059-2) que será expandido para algo em torno de uma representação de 2X o genoma de L. brasiliensis geradas dentro do projeto 99/12403-3 e com a colaboração de outros laboratórios no país. Para o desenvolvimento das ferramentas de bioinformática e estabelecimento dos "scripts" de análise contaremos com a colaboração do Prof. Peter Myler (SBRI - Seattle Biomedical Research Institute, Seattle, EUA). Um outro objetivo abordado por este projeto é a finalização das regiões de "gaps" localizados nas regiões extremas do cromossomo 2 de L. major que englobam o tandem do gene do miniexon e a região telomérica. Utilizaremos para tanto a técnica de transposição in vitro como "ilha de iniciadores" para seqüenciamento. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

LAURENTINO, ELIANE C.; RUIZ, JERONIMO C.; BRITO, LOISLENE O.; FIANDT, MICHAEL; NICOLETTI, LILIANA M.; JAMUR, M. C.; OLIVER, C.; TOSI, LUIZ R. O.; CRUZ, ANGELA K.. The use of Tn5 transposable elements in a gene trapping strategy for the protozoan Leishmania. International Journal for Parasitology, v. 37, n. 7, p. 735-742, June 2007. (00/10059-2, 99/12403-3, 01/13461-9)