Eletroforese de campo pulsado para enriquecimento do DNA de Candidatus Liberibacter americanus multiplicado em vinca (Catharanthus roseus) e hibridação subtrativa supressiva: abordagens

• Processo: 08/52230-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Pesquisa
• Data de Início da vigência: 24 de junho de 2008
• Data de Término da vigência: 23 de setembro de 2008
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Fitossanidade
• Pesquisador responsável: Nelson Arno Wulff
• Beneficiário: Nelson Arno Wulff
• Pesquisador Anfitrião: Sandrine Jagoueix-Eveillard
• Instituição Sede: Fundo de Defesa da Citricultura (FUNDECITRUS). Araraquara , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), França
• Assunto(s): Citrus Genômica Análise de sequência de DNA
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Citrus | Genomica | Huanglongbing | Liberibacer Spp | Pfge | Sequenciamento

Resumo

A presente proposta de pesquisa visa empregar uma abordagem até agora não avaliada para obter-se enriquecimento do DNA de Ca. Liberibacter americanus. Nossa proposta é de empregar um protocolo para enriquecimento de DNA genômico idêntico ao utilizado para a produção de mapa físico e genético em fitoplasmas (enriquecimento físico), a partir de liberibacter enriquecida em vinca (enriquecimento biológico). Neste protocolo a eletroforese em campo pulsado (PFGE) é efetuada com a amostra enriquecida em DNA bacteriano produzida em bloco de agarose, o que reduz drasticamente a quebra do DNA genômico em fragmentos pequenos, viabilizando a produção de fragmentos maiores que 30 kb, sendo possível inclusive a visualização do cromossomo em tamanhos de 1 até 5 Mpb... (AU)