Modelagem física da molécula de DNA

• Processo: 02/13930-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Pesquisa
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2003
• Data de Término da vigência: 29 de fevereiro de 2004
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Física - Física Atômica e Molecular
• Pesquisador responsável: Alexandre Fontes da Fonseca
• Beneficiário: Alexandre Fontes da Fonseca
• Pesquisador Anfitrião: Wilma King Olson
• Instituição Sede: Pessoa Física
• Instituição Anfitriã: Rutgers The State University of New Jersey, New Brunswick, Estados Unidos
• Assunto(s): Modelagem molecular DNA Estrutura do DNA
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Dependencia Com A Sequencia | Estrutura Do Dna | Fisica Do Dna | Interacao Dna Proteina | Niveis De Modelagem

Resumo

O estudo do comportamento físico da molécula de DNA é de fundamental importância para o entendimento dos processos vitais associados a ela. Existem vários níveis de modelagem física da molécula de DNA. Neste projeto apresentamos uma proposta de trabalho que envolve 3 níveis de modelagem. Primeiramente, será feito o cálculo dos módulos de Young e de cisalhamento em função da seqüência de DNA, com o objetivo de aplicação em nível dos modelos elásticos contínuos. Em seguida, estudaremos a neutralização da carga do grupo fosfato do DNA, devido à ação de proteínas, numa modelagem em nível atômico. Por fim, introduziremos interações eletrostáticas num modelo de pares de base para analisar os efeitos sobre os modos normais de vibração da molécula. (AU)