Identificação e caracterização do gene PKHD1 e seu produto

• Processo: 00/14187-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2001
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2003
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Luiz Fernando Onuchic
• Beneficiário: Luís Fernando Carvalho de Menezes
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina (FM). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Mapeamento genético Mutação Gene PKD1 Fibrose Rim policístico autossômico recessivo
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cistogenese Renal | Deteccao De Mutacoes | Fibrose Portal | Gene Pkhd1 | Mapeamento Genetico

Resumo

A doença de rim policístico autossômica recessiva (DRPAR) é uma das doenças renais císticas hereditárias mais freqüentes na criança, constituindo-se numa importante causa de mortalidade e morbidade. Apresenta espectro clínico amplo, manifesta-se mais freqüentemente na infância e seu quadro clínico inclui nefromegalia bilateral, oligohidrâmnio, insuficiência respiratória, hipertensão arterial sistêmica, insuficiência renal progressiva e hipertensão portal. As alterações anátomo-patológicas caracterizam-se por dilatações fusiformes ou cilíndricas de duetos coletores renais, em disposição radial da medula ao córtex, e por um processo de disgenesia biliar associado a fibrose portal. O defeito genético primário e a fisiopatologia molecular da DRPAR são ainda desconhecidos. Sabe-se que a doença é geneticamente homogênea em suas formas típicas, com as formas perinatal severa e mais brandas e tardias mapeando-se ao mesmo locus localizado em 6p21.1-p12. Nos últimos anos, o orientador desta tese vem participando ativamente das várias etapas do processo de clonagem deste gene, denominado PKHD1 (polycystic kidney and hepatic disease 1). A estratégia utilizada tem sido a candidato-posicional. Em 1997, foi gerado um contig de YACs cobrindo o intervalo genético da doença. A seguir, esta região foi saturada com marcadores polimórficos e o posicionamento do PKHD1 refinado a um intervalo inferior a 1cM. O mapa físico baseado em YACs foi então convertido em um mapa baseado em PACs e BACs, com densidade média de STSs de 1/20 kb e tamanho estimado de cerca de 1,0 Mb. Resultados de recombinação mais recentes reduziram ainda mais o intervalo crítico. A construção do mapa de transcrição da região de interesse encontra-se em fase avançada, incluindo 29 porções de seqüências expressas, a maior parte pertencentes a genes novos. Esta projeto de pesquisa pretende concluir a identificação de PKHD1 e avançar neste trabalho, tendo como objetivos: 1)refinar o mapa genético da DPRAR; 2) completar o mapa de transcrição do intervalo PKHD1; 3)selecionar genes candidatos, submetê-los a análises de mutações e identificar PKHD1\ 4)estabelecer a organização genômica do gene; 5)caracterizar a natureza das mutações em PKHD1 e procurar por possíveis correlações genótipo-fenótipo na DRPAR; 6) gerar anticorpos à proteína codificada pelo gene PKHD1 e caracterizar seu padrão de expressão. (AU)