Forcas intermoleculares: ligacao de hidrogenio em biomoleculas.

• Processo: 98/15386-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 1999
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2001
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Física - Física Atômica e Molecular
• Pesquisador responsável: Sylvio Roberto Accioly Canuto
• Beneficiário: Valdemir Eneias Ludwig
• Instituição Sede: Instituto de Física (IF). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Química quântica Ligação de hidrogênio Forças intermoleculares Moléculas bioativas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biomoleculas | Forcas Intermoleculares | Ligacao De Hidrogenio | Quimica Quantica

Resumo

Neste projeto pretende-se estudar por métodos ab initio as forças intermoleculares envolvendo pontes de hidrogênio entre nucleotídeos e água. A importância destas forças pode ser exemplificada pela sua participação num grande número de processos bioquímicos como, por exemplo, o enovelamento de proteínas. A variação das propriedades moleculares em meio aquoso, quando comparadas com as mesmas propriedades para a molécula isolada é de grande interesse. Este é essencialmente o nosso enfoque teórico: estudar, propriedades estruturais e espectroscópicas de moléculas biológicas em meio aquoso. A interação de moléculas com um meio tem sido estudada através do chamado modelo contínuo ou modelo de cavidade, que utiliza as idéias clássicas desenvolvidas por Onsager e Kirkwood. Neste, o meio é caracterizado apenas por sua constante dielétrica. Ainda que este meio dielétrico seja polarizável, não é possível usar este modelo quando ocorrem interações específicas, como ligações de hidrogênio, interação hidrofóbica ou hidrofílica, etc. Mas estas são exatamente as interações fundamentais para se entender os processos bioquímicos. Não é possível entender processos bioquímicos desprezando-se estas interações específicas. Nossa intenção é considerar explicitamente formação de ligações de hidrogênio, interações hidrofóbicas e hidrofílicas e efeitos de temperatura. Para isto utilizaremos nossa metodologia que combina métodos clássicos (Monte Carlo) e quânticos. A simulação clássica utiliza um programa desenvolvido em nosso grupo, enquanto que os cálculos quânticos podem ser realizados por métodos de química quântica usando-se métodos ab initio ou semi-empírico. (AU)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

LUDWIG, Valdemir Eneias. Estudo teórico de propriedades espectroscópicas do complexo guanina-citosina. 2001. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Física (IF/SBI) São Paulo.