Estudo teórico de propriedades espectroscópicas do complexo guanina-citosina

Autor(es)

Valdemir Eneias Ludwig

• Tipo de documento: Dissertação de Mestrado
• Imprenta: São Paulo.
• Instituição: Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Física (IF/SBI)
• Data de defesa: 2001-04-06

Membros da banca

Sylvio Roberto Accioly Canuto; Antonio Carlos Borin; Willian Ricardo Rocha

• Orientador: Sylvio Roberto Accioly Canuto

Resumo

Besta dissertação estudamos teoricamente as modificações estrturais e espectroscópicas decorrentes da interação guanina-citosina na estrutura de Watson-Crick com três ligações de hidrogênio. Utilizando métodos \"ab initio\" Hartree-Fock, teoria deperturbação de segunda ordem e teoria do funcional da densidade empregando os funcionais B3LYP, BP86 com diferentes funções base otimizamos a geometria da guanina, citosina e do complexo guanina-citosina. As modificações estruturais devido à complexação são analisadas e comparadas entre si e com os resultados experimentais existentes. A energia de ligação é obtida usando os mesmos métodos em que a molécula foi otimizada e corrigida devido ao erro de superposição de bases e as energias de ponto zero. Os nossos resultados obtém uma energia de ligação em boa concordância com os resultados experimentais, mas superestima este valor por 1-2 kcal/mol. O espectro infra-vermelho é calculado e uma análise detalhada é feita da mudança das freqüências vibracionais devido à formação do complexo. Analogamente o espectro UV-visível é calculado para a guanina citosina e para o complexo usando o método de até 1500 \'cm POT. -1\' devido à formação do complexo. Adicionalmente uma transição de baixa intensidade associada com a tranferência de carga da guanina para a citosina é identificada. Finalmente, os efeitos de solventes (água) são estimados usando-se o modelo de campo de reação auto-consistente (AU)

• Processo FAPESP: 98/15386-0 - Forcas intermoleculares: ligacao de hidrogenio em biomoleculas.
• Beneficiário: Valdemir Eneias Ludwig
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado