Projeto genoma-fapesp: sequenciamento do genoma de xylella fastidiosa.

• Processo: 98/15160-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 1999
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2000
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Francisco Gorgônio Nóbrega
• Beneficiário: Cassio da Silva Baptista
• Instituição Sede: Instituto de Pesquisa e Desenvolvimento (IP&D). Universidade do Vale do Paraíba (UNIVAP). São José dos Campos , SP, Brasil
• Assunto(s): Xylella fastidiosa Transposons Enzimas de restrição Análise de sequência de DNA
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Clonagem De Dna | Cosmideo | Enzimas De Restricao | Sequenciamento De Dna | Transposon | Xylella Fastidiosa

Resumo

O trabalho consiste na participação no seqüenciamento de'50000 pares de bases do genoma da xylella fastidiosa. O primeiro estagio do trabalho será o seqüenciamento de um cosmídeo de mais ou menos 45000pb, do genoma da bactéria que já esta em andamento. O estudo utiliza inserção de transfosons para seqüenciar segmentos subclonados do genoma. Esta estratégia poderá ajudar em estudos subseqüentes sobre função dos genes detectados. Paralelamente pretende-se seqüenciar clones aleatórios obtidos por nebolização do dna do cosmíde o. Para tal utilizamos técnicas estabelecidas de biologia molecular e aparelhagem especifica para seqüenciamento rápido ("dye terminator cycle sequencing). A montagem da seqüência será feita utilizando-se os programas sequencer e phed phap consed. O fechamento do cosmídeo e sua análise serão etapas finais do trabalho. (AU)