Estudo em larga escala dos genes expressos no sistema nervoso de humano e de camundongo a partir de dados públicos

• Processo: 03/12323-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2004
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2008
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Bettina Malnic
• Beneficiário: Pedro Alexandre Favoretto Galante
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Biologia computacional Sistema nervoso Expressão gênica Processamento alternativo
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bioinformatica | Expressao Genica | Sistema Nervoso | Splicing Alternativo

Resumo

O Sistema Nervoso é constituído por bilhões de células que se interconectam em circuitos diferentes, sendo responsável, tanto pela nossa percepção do mundo exterior quanto pelo controle de nossas ações. O primeiro passo necessário para compreendermos o funcionamento deste Sistema é saber de que forma os genes contribuem para a formação da complexidade inerente a ele. No presente trabalho utilizaremos os dados públicos de cDNAs, SAGE e 'microarrays' para estudar os genes cerebrais de humano e de camundongo. Serão abordados quatro aspectos: (i) a expressão gênica por região cerebral; (ii) a associação destes genes com doenças conhecidas; (iii) a freqüência, o tipo e a influência de "splicing" alternativo nestes genes cerebrais; (iv) um estudo comparativo entre os genes cerebrais de humanos e de camundongos. Para alguns destes genes faremos uma comprovação experimental, através de técnicas de Biologia Molecular, da expressão preferencial no cérebro, da expressão especificas nas regiões cerebrais e dos variantes gerados por "splicing" alternativo. Por fim, realizaremos uma seleção de genes candidatos para a construção de 'arrays' de cDNAs e construiremos uma interface para tomar todos os dados acessíveis via Internet. (AU)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

GALANTE, Pedro Alexandre Favoretto. Uso de técnicas computacionais no estudo da transcrição e regulação gênica em Homo sapiens e Mus musculus. 2008. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Conjunto das Químicas (IQ e FCF) (CQ/DBDCQ) São Paulo.