Bioinformática estrutural aplicada ao estudo de enzimas da via metabólica do ácido chiquímico

• Processo: 04/10318-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2005
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2008
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
• Pesquisador responsável: Mario Sergio Palma
• Beneficiário: Helen Andrade Arcuri
• Instituição Sede: Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Desenho de drogas Ácido chiquímico Biologia computacional
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bioinformatica Estrutural | Desenho De Drogas

Resumo

O presente projeto de pesquisa de doutorado visa a modelagem molecular de enzimas da via metabólica do ácido chiquímico identificadas em genomas de microrganismos, exceto as vias que apresentarem enzimas multifuncionais. A via metabólica do ácido chiquímico é exclusiva de microrganismos e plantas, o que fazem dessas enzimas alvos em potencial para o desenho de drogas. A partir deste estudo estrutural, usando-se modelagem molecular, será possível propor inibidores específicos para cada enzima, o que poderá gerar drogas, eficazes contra os patógenos causados por esses organismos. O estudo estrutural de um grande número de enzima permitirá que ocorram avanços no entendimento da função molecular, nas interações proteína-ligante e no mecanismo de proteínas. Os modelos obtidos para as enzimas serão disponibilizados num banco de dados com acesso via web. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

ARCURI, HELEN A.; ZAFALON, GERALDO F. D.; MARUCCI, EVANDRO A.; BONALUMI, CARLOS E.; DA SILVEIRA, NELSON J. F.; MACHADO, JOSE M.; DE AZEVEDO, JR., WALTER F.; PALMA, MARIO S.. SKPDB: a structural database of shikimate pathway enzymes. BMC Bioinformatics, v. 11, JAN 7 2010. (04/10318-9)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

ARCURI, Helen Andrade. Bioinformática estrutural aplicada ao estudo de enzimas da via metabólica do ácido chiquímico. 2008. Tese de Doutorado - Universidade Estadual Paulista (Unesp). Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas. São José do Rio Preto São José do Rio Preto.