Algoritmos evolutivos aplicados na investigação da adaptabilidade do código genético

Autor(es)

Lariza Laura de Oliveira

• Tipo de documento: Tese de Doutorado
• Imprenta: São Paulo.
• Instituição: Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Matemática e Estatística (IME/SBI)
• Data de defesa: 2015-11-30

Membros da banca

Renato Tinós; Marcelo Mendes Brandão; Odemir Martinez Bruno; André Carlos Ponce de Leon Ferreira de Carvalho; Sergio Russo Matioli

• Orientador: Renato Tinós

Resumo

O código genético é altamente conservado e está presente na maior parte dos organismos vivos. Uma questão que tem intrigado os cientistas é se o código genético é fruto do acaso ou de um processo evolutivo. Se qualquer associação entre aminoácidos e códons é possível, então existem cerca de 1, 51 × 1084 códigos possíveis. A hipótese de que o código genético evoluiu é suportada por sua robustez frente a mutações. Duas metodologias tem sido utilizadas para estudar esta hipótese: a abordagem estatística, que estima o número de códigos aleatórios melhores que o código genético padrão, e a abordagem por engenharia, que compara o código padrão com os melhores códigos hipotéticos obtidos por meio de um algoritmo de otimização. A utilização de ambas abordagens têm sido feita considerando-se apenas uma função objetivo, baseada na robustez frente a mutações quando uma determinada propriedade dos aminoácidos é considerada. Neste trabalho, propõe-se considerar mais de um objetivo simultaneamente para a avaliação dos códigos genéticos. Para isso, três abordagens multiobjetivo utilizando Algoritmos Genéticos são empregadas. São elas: abordagem lexicográfica, ponderada e de Pareto. Os resultados indicam que a utilização de mais de um objetivo é promissor, sendo os códigos hipotéticos gerados mais similares ao código genético padrão, quando comparados com os resultados obtidos por outros autores. (AU)

• Processo FAPESP: 11/00561-7 - Auto-Organização em Algoritmos Evolutivos Aplicados na Investigação da Adaptabilidade do Código Genético
• Beneficiário: Lariza Laura de Oliveira
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado