Texto completo
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| Autor(es): |
Caroline Simões Pereira
Número total de Autores: 1
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| Tipo de documento: | Tese de Doutorado |
| Imprenta: | Campinas, SP. |
| Instituição: | Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Química |
| Data de defesa: | 2021-01-29 |
| Membros da banca: |
Munir Salomão Skaf;
Ernesto Raúl Caffarena;
Pedro Geraldo Pascutti;
Leandro Martínez;
Cláudio Francisco Tormena
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| Orientador: | Munir Salomão Skaf |
| Resumo | |
Plantas e algas marinhas são fontes renováveis de matérias-primas para produção de biocombustíveis e produtos químicos de alto valor agregado. O aumento da eficiência de sua aplicação depende do desenvolvimento de coquetéis enzimáticos. Para isso, é necessário o entendimento dos mecanismos que ação dessas enzimas. Além disso, as plantas possuem uma parede celular com arquitetura complexa, ainda pouco entendida, de interação entre celulose, hemicelulose e lignina que confere alta recalcitrância à ação de enzimas. Neste trabalho, apliquei simulações de dinâmica molecular para estudar enzimas que catalisam a clivagem de polissacarídeos e aspectos da arquitetura da parede celular de plantas. Os sistemas estudados foram: (1) A interação da hemicelulose glucomanano com diferentes faces da microfibrila de celulose utilizando simulação de dinâmica molecular clássica; (2) Os mecanismos de reação de hidrólise da celulose pela endoglucanase pertencente à família GH45 subfamília C de Phanerochaete chrysosporium e de degradaçao de peptidoglicano pela transglicosilase lítica MltA de Escherichia coli utilizando simulações com método híbrido mecânica quântica/mecânica molecular (QM/MM) para obtenção da superfície de energia livre das reações do mecanismo proposto; (3) As interações enzima- substrato e as alterações conformacionais da ß-Agarase da batéria marinha Saccharophagus degradans da família 50 utilizando simulações clássicas de dinâmica molecular com métodos de amostragem ampliada (AU) | |
| Processo FAPESP: | 15/25031-1 - Dinâmica molecular de enzimas modificadores de de carbohidratos para desconstrução e valorização de biomassa lignocelulósica |
| Beneficiário: | Caroline Simões Pereira |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Doutorado |