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Grafos de sequencias de DNA

Texto completo
Autor(es):
Marília Dias Vieira Braga
Número total de Autores: 1
Tipo de documento: Dissertação de Mestrado
Imprenta: Campinas, SP.
Instituição: Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Computação
Data de defesa:
Membros da banca:
João Meidanis; Eduardo Sany Laber; Cid Carvalho de Souza
Orientador: João Meidanis
Resumo

Este trabalho está relacionado à Biologia Computacional, uma área da Ciência da Computação cuja existência é motivada pela busca de métodos computacionais que resolvam ou ajudem a resolver problemas de origem biológica. Esta ciência tem sido largamente utilizada no âmbito da genética, contribuindo essencialmente no seqüenciamento de cadeias de DNA e no mapeamento de genomas [11]. O foco do nosso projeto foi uma família de problemas denominada Minimum Contig Problems (MCP) [4], que é um modelo teórico para a abordagem da Montagem de Fragmentos de DNA [11] e que possui uma grande semelhança com um problema de grafos denominado Cobertura de Vértices por Caminhos (CVC) [4]. O principal resultado da nossa pesquisa foi a apresentação de provas formais da NP-dificuldade dos problemas de MCP. A partir daí, complementamos o nosso trabalho propondo um algoritmo de aproximação para instâncias restritas de cada problema de MCP. (AU)

Processo FAPESP: 97/11629-2 - Grafos de sequencias de dna.
Beneficiário:Marilia Dias Vieira Braga
Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado