Fitting 3D deformable biological models to microscope images

Autor(es)

Danillo Roberto Pereira

• Tipo de documento: Tese de Doutorado
• Imprenta: Campinas, SP.
• Instituição: Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Computação
• Data de defesa: 2013-08-16

Membros da banca

Jorge Stolfi; Luiz Henrique de Figueiredo; Marco Antônio Piteri; Anamaria Gomide; Hélio Pedrini

• Orientador: Jorge Stolfi

Resumo

Nesta tese descrevemos um algoritmo genérico (que denominamos MSFit) capaz de estimar a pose e as deformações de modelos 3D de estruturas biológicas (bactérias, células e etc.) em imagens obtidas por meio de microscópios óticos ou de varredura eletrônica. O algoritmo usa comparação multi-escala de imagens utilizando uma métrica sensível ao contorno; e um método original de otimização não-linear. Nos nossos testes com modelos de complexidade moderada (até 12 parâmetros) o algoritmo identifica corretamente os parâmetros do modelo em 60-70% dos casos com imagens reais e entre 80-90% dos casos com imagens sintéticas (AU)

• Processo FAPESP: 09/13744-2 - Alinhamento de modelos biológicos tridimensionais com imagens microscópicas
• Beneficiário: Danillo Roberto Pereira
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado