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Fernando Luis Barroso da Silva

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Universidade de São Paulo (USP). Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP)  (Instituição-sede da última proposta de pesquisa)
País de origem: Brasil

Fernando Luís Barroso da Silva concluiu seu Ph.D. em Theoretical Chemistry/Physical Chemistry, pela Lunds Universitet (Suécia) em 2000. Atualmente, é Professor Associado da Universidade de São Paulo (USP) e orientador do programa de Pós-graduação interunidades em Bioinformática da USP. Foi professor visitante da Lunds Universitet/Suécia (2013/2014), University College Dublin/Irlanda (2016) Universidade Sorbonne Paris Cité/França (2015/16, 2017/18 e 2018/19) e outras. Publicou 40 artigos em periódicos especializados, centenas de trabalhos em anais de eventos e ministrou várias palestras no Brasil e no exterior. Possui 1 livro publicado e 2 capítulos de livro. Organizou eventos científicos no Brasil, na Irlanda e na Suécia. Foi relator de várias dezenas de publicações/projetos de pesquisa. Orientou 5 dissertações de mestrado, 1 tese de doutoramento, 1 pós-doc, 11 trabalhos de iniciação científica e 1 de pré-iniciação científica, dentre outras co-orientações, nas áreas de Físico-química, Biofísica Molecular e Bioinformática. Orienta hoje 1 aluno de doutorado, 1 de mestrado e 1 de iniciação científica. Desde 2000, participou de 15 projetos de pesquisa, sendo coordenador de 8 destes. Atualmente coordena de 3 projetos de pesquisa. Atua nas áreas de Biofísica Molecular, Biofísico-química e Bioinformática Estrutural, com ênfase no entendimento de mecanismos moleculares através de técnicas de simulação computacional. Em suas atividades profissionais interagiu com centenas de colaboradores em co-autorias de trabalhos científicos. Em seu currículo Lattes, os termos mais freqüentes na contextualização de sua produção são: interações eletrostáticas em e entre proteínas, Monte Carlo, Energia Livre, simulação computacional, Poisson-Boltzmann, forças fundamentais Biofísica, pH, Tanford-Kirkwood.

Gerado pelo Sistema Interlattes CV-Resumé (Fonte: Currículo Lattes)

Auxílios à pesquisa
Bolsas no país
Apoio FAPESP em números * Quantidades atualizadas em 16/01/2021
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Palavras-chave utilizadas pelo pesquisador
Publicações resultantes de Auxílios e Bolsas sob responsabilidade do(a) pesquisador(a) (14)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

Publicações14
Citações69
Cit./Artigo4,9
Dados do Web of Science

PASQUALI, S.; FREZZA, E.; BARROSO DA SILVA, F. L.. Coarse-grained dynamic RNA titration simulations. INTERFACE FOCUS, v. 9, n. 3, . Citações Web of Science: 1. (15/16116-3)

BARROSO DA SILVA, FERNANDO LUIS; MACKERNAN, DONAL. Benchmarking a Fast Proton Titration Scheme in Implicit Solvent for Biomolecular Simulations. JOURNAL OF CHEMICAL THEORY AND COMPUTATION, v. 13, n. 6, p. 2915-2929, . Citações Web of Science: 5. (15/16116-3)

BARROSO DA SILVA, FERNANDO LUIS; DERREUMAUX, PHILIPPE; PASQUALI, SAMUELA. Fast coarse-grained model for RNA titration. Journal of Chemical Physics, v. 146, n. 3, . Citações Web of Science: 6. (10/50425-0, 15/16116-3)

POVEDA-CUEVAS, SERGIO A.; ETCHEBEST, CATHERINE; BARROSO DA SILVA, FERNANDO L.. Identification of Electrostatic Epitopes in Flavivirus by Computer Simulations: The PROCEEDpKa Method. JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING, v. 60, n. 2, p. 944-963, . Citações Web of Science: 1. (15/16116-3, 19/06139-7)

POVEDA-CUEVAS, SERGIO A.; ETCHEBEST, CATHERINE; BARROSO DA SILVA, FERNANDO L.. Insights into the ZIKV NS1 Virology from Different Strains through a Fine Analysis of Physicochemical Properties. ACS OMEGA, v. 3, n. 11, p. 16212-16229, . Citações Web of Science: 0. (15/16116-3)

BARROSO DA SILVA, FERNANDO LUIS; STERPONE, FABIO; DERREUMAUX, PHILIPPE. OPEP6: A New Constant-pH Molecular Dynamics Simulation Scheme with OPEP Coarse-Grained Force Field. JOURNAL OF CHEMICAL THEORY AND COMPUTATION, v. 15, n. 6, p. 3875-3888, . Citações Web of Science: 2. (15/16116-3)

BARROSO DA SILVA, FERNANDO LUIS; DERREUMAUX, PHILIPPE; PASQUALI, SAMUELA. Protein-RNA complexation driven by the charge regulation mechanism. Biochemical and Biophysical Research Communications, v. 498, n. 2, SI, p. 264-273, . Citações Web of Science: 7. (15/16116-3)

DELBONI, LARIANI APARECIDA; BARROSO DA SILVA, FERNANDO LUIS. On the complexation of whey proteins. FOOD HYDROCOLLOIDS, v. 55, p. 89-99, . Citações Web of Science: 11. (10/50425-0)

BARROSO DA SILVA, FERNANDO LUIS; BOSTROM, MATHIAS; PERSSON, CLAS. Effect of Charge Regulation and Ion-Dipole Interactions on the Selectivity of Protein-Nanoparticle Binding. Langmuir, v. 30, n. 14, p. 4078-4083, . Citações Web of Science: 20. (10/50425-0)

MENDONCA, DEBORAH C.; MACEDO, JOCI N.; GUIMARAES, SAMUEL L.; BARROSO DA SILVA, FERNANDO L.; CASSAGO, ALEXANDRE; GARRATT, RICHARD C.; PORTUGAL, RODRIGO V.; ARAUJO, ANA P. U.. A revised order of subunits in mammalian septin complexes. CYTOSKELETON, v. 76, n. 9-10, p. 457-466, . Citações Web of Science: 0. (15/16116-3, 14/15546-1, 17/15340-2)

BARROSO DA SILVA, FERNANDO LUIS; PASQUALI, SAMUELA; DERREUMAUX, PHILIPPE; DIAS, LUIS GUSTAVO. Electrostatics analysis of the mutational and pH effects of the N-terminal domain self-association of the major ampullate spidroin. SOFT MATTER, v. 12, n. 25, p. 5600-5612, . Citações Web of Science: 10. (13/08166-5, 10/50425-0)

MONTELLANO DURAN, NATALIA; SPELZINI, DARIO; WAYLLACE, NATAEL; BOERIS, VALERIA; BARROSO DA SILVA, FERNANDO L.. A combined experimental and molecular simulation study of factors influencing interaction of quinoa proteins-carrageenan. International Journal of Biological Macromolecules, v. 107, n. A, p. 949-956, . Citações Web of Science: 5. (15/16116-3)

FRIGORI, RAFAEL B.; BARROSO DA SILVA, FERNANDO L.; CARVALHO, PATRICIA P. D.; ALVES, NELSON A.. Occurrence of Biased Conformations as Precursors of Assembly States in Fibril Elongation of Amyloid-beta Fibril Variants: An In Silico Study. Journal of Physical Chemistry B, v. 124, n. 14, p. 2798-2805, . Citações Web of Science: 0. (15/16116-3, 16/04176-4)

GIRON, CAROLINA CORREA; LAAKSONEN, AATTO; BARROSO DA SILVA, FERNANDO L.. On the interactions of the receptor-binding domain of SARS-CoV-1 and SARS-CoV-2 spike proteins with monoclonal antibodies and the receptor ACE2. VIRUS RESEARCH, v. 285, . Citações Web of Science: 1. (15/16116-3)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

CARVALHO, Sidney Jurado de. Estudo metodológico dos aspectos eletrostáticos da interação ligante-biomolécula.  97 f. Dissertação (Mestrado) -  Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.  Universidade Estadual Paulista.  São José do Rio Preto.  (01/12566-1

CARVALHO, Sidney Jurado de. Estudo dos aspectos eletrostáticos da interação entre polieletrólitos e macroíons.  116 f. Tese (Doutorado) -  Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.  Universidade Estadual Paulista.  São José do Rio Preto.  (04/01268-8

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