Experiências em genômica comparativa e filogenômica em Tripanosomatídeos, bactérias e vírus. Experiencia como engenheiro bioinformata no desenvolvimento de workflows automatizados para análises em bioinformática usando tecnologia de virtualização (docker e singularidade) e tecnologia de automação como Nextflow implementados em ambientes de alta performance como AWS e HPC. Experiencia como analista bioinformata processando dados NGS de amostras clínicas para encontrar variantes genéticas de doenças raras e hereditárias usando software como GATK4 e outros. Trabalhei no mapeamento das principais funcionalidades das infraestructuras das plataformas e repositorios das principais iniciativas genômicas e de medicina genômica do mundo para subsidiar a futura construção do repositório de dados e da plataforma de dados do Programa Genomas Brasil. (Fonte: Currículo Lattes)
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A inferência de ancestralidade local (LAI) é essencial para compreender a diversidade genética e as dinâmicas populacionais em populações miscigenadas. Eventos históricos como migração, colonização e escravidão criaram um mosaico de linhagens ancestrais, complicando o estudo de associações genéticas com doenças. Métodos como análise de componentes principais (PCA) e admixture mapping são …
Atualmente, vislumbramos uma contínua e massiva produção de dados de sequenciamento de nova geração (NGS - Next Generation Sequencing) resultantes da redução de custos e melhor desempenho dessas tecnologias. Esses dados são processados em fluxos de trabalho (workflows), adaptados de acordo com as necessidades de análise genômica através de vários softwares conectados (pipelines). No entan…
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