CV Lattes
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Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Rio Claro. Instituto de Geociências e Ciências Exatas (IGCE) (Instituição Sede da última proposta de pesquisa) País de origem: Brasil
possui graduação em Engenharia Elétrica pela Universidade Federal de Juiz de Fora (1983), mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional pela Universidade de São Paulo (1988), doutorado em Física - Física Computacional pela Universidade de São Paulo (1996) e Livre Docência pela Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP (2015). Realizou estágios de pós-doutorado na Universidade de Warwick, Coventry, Inglaterra (1999-2000), e na Universidade Claude Bernard Lyon 1, Villeurbanne, França (2013). Atualmente é professor livre-docente da Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, em Rio Claro, junto ao Curso de Bacharelado em Ciências da Computação. Tem experiência na área de Ciência da Computação, atuando nos temas: bioinformática (interesse especial) e modelagem e simulação de sistemas. (Fonte: Currículo Lattes)
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O projeto geral visa desenvolver um ambiente computacional que integre sistemas e aplicativos que serão usados como ferramentas auxiliares em processos de análises de dados genômicos. Em especial, esta proposta tem por objetivo desenvolver e integrar ferramentas de Bioinformática voltadas para a (pré-)análise de alguns marcadores moleculares e polimorfismos, a saber, Elementos Transponive…
O Grupo de Bioinformática de Rio Claro desenvolveu um ambiente computacional, o SATE Comp, voltado para auxiliar a anotação de Elementos Transponíveis (TEs) em sequências genômicas. O SATE Comp utiliza o processo de homologia e também Modelos Ocultos de Markov (HMMs), produzindo resultados comparativos entre as duas formas de identificação. Um projeto de IC finalizado em 2012 e outro em 2…
SATE Comp é um ambiente computacional voltado para auxiliar processos de análise de Elementos Transponíveis (TEs). O SATE Comp identifica e classifica TEs em sequências genômicas através do processo de homologia (usando o aplicativo Repeat Masker) e utilizando Modelos Ocultos de Markov (HMMs) (usando o aplicativo HMMER). Neste projeto, o aluno buscará formas de melhorar os resultados obti…
O Grupo de Bioinformática de Rio Claro desenvolveu um ambiente computacional, denominado SATEComp, voltado para auxiliar processos de análise de Elementos Transponíveis (TEs) identificados em bancos de dados genômicos. Este ambiente oferece vários recursos que visam facilitar e agilizar este tipo de processo de análise, inclusive possibilitando a comparação de organismos que tiveram seus…
Elementos Transponíveis são trechos de DNA que podem se "mover" de um local para outro dentro de um genoma. Modelos Ocultos de Markov são modelos estatísticos que estão sendo utilizados na solução de alguns problemas da Biologia Molecular. Neste projeto de pós-doutorado, o proponente direcionará as pesquisas visando a aplicação de Modelos Ocultos de Markov para a identificação e classific…