Cristiane Hayumi Taniguti

Atualmente trabalho como Coordenadora em Genômica no Programa Breeding Insight na Universidade de Cornell. Anteriormente fui pesquisadora de pós-doutorado no Programa de Melhoramento e Genética de Rosas da Texas AM University no Departamento de Ciências Hortícolas, com foco no desenvolvimento de ferramentas computacionais para análise genética de espécies poliploides. Ao longo do meu percurso académico, adquiri diversas experiências de investigação em diversas áreas.Durante minha graduação, participei de projetos de iniciação científica em diversas áreas incluindo química orgânica de micotoxinas fúngicas, regulação celular de fatores de transcrição CNC, estudos de QTLs para deposição de gordura em camundongos, estudos de expressão diferencial em Anastrepha obliqua e identificação de marcadores genéticos em dados de genotipagem-por-sequenciamento (GBS) em cana-de-açúcar. Essas experiências me proporcionaram uma base sólida em técnicas laboratoriais como cromatografia, culturas celulares, western blot, RNAi e RT-PCR.No mestrado, me aprofundei nos métodos para identificação de marcadres SNP e de chamada de genótipos e construí um mapa genético integrado para uma população F1 segregante a partir do cruzamento de Eucalyptus grandis x Eucalyptus urophylla.Para meu doutorado, concentrei-me no desenvolvimento de novos métodos e algoritmos para construir mapas genéticos em espécies diplóides altamente heterozigotas usando marcadores gerados a partir de tecnologias modernas de sequenciamento. Este trabalho não só contribuiu para avanços no software OneMap para construção de mapas de ligação, mas também levou ao desenvolvimento de uma coleção de workflows de bioinformática chamada Reads2Map. Esses workflows fornecem orientação sobre as melhores práticas para executar e comparar diferentes métodos de chamada de SNP, dosagem e construção de mapa de ligação.Na minha atual pesquisa de pós-doutorado, ampliei a aplicação do Reads2Map para incluir espécies poliplóides. Adicionalmente, sou responsável pelo desenvolvimento e manutenção do pacote VIEWpoly, um aplicativo Shiny que facilita a visualização e integração de resultados de análises genéticas de espécies poliploides. Além disso, também tenho trabalhado em um novo software chamado Qploidy para identificação de aneuploidia usando dados da plataforma de genotipagem de array. Como parte do meu envolvimento no Workshop Tools for Polyploids, contribuo com a equipe de suporte computacional.Meus outros interesses incluem mapeamento de QTL, tecnologias emergentes em biologia molecular e sequenciamento, métodos de fenotipagem, seleção genômica e estudos de associação genômica ampla. Colaborei em estudos de ligação e mapeamento de QTL em seringueiras, rosas, miscanthus, cannabis, feijão e eucalipto. Como mantenedor dos softwares OneMap, Reads2Map e VIEWpoly, frequentemente forneço assistência aos usuários na realização de mapeamento de ligação em múltiplas espécies, ao mesmo tempo em que aprimoro continuamente o software com base no feedback do usuário e nas crescentes demandas de pesquisa. (Fonte: Currículo Lattes)