Ontologias e bancos de dados para pesquisa em genômica funcional de Schistosoma mansoni

Resumo

A adoção de ontologias biológicas tem como objetivo primordial superar o problema da heterogeneidade de termos normalmente encontrada. KEGG e Gene Ontology são bons exemplos disso. Um esquema de adoção de ontologias consiste na adoção de múltiplas ontologias simples e organizadas em níveis independentes. Além das ontologias, outro fator importante no armazenamento eficiente de grandes volumes de informações são os bancos de dados biológicos. Bons exemplo são GenBank e SWISS-PROT. O projeto visa consolidar as ontologias gênicas já existentes para o transcriptoma de Schistosoma mansoni (SmAEs), através de programas a serem desenvolvidos, e organizar um vocabulário de ontologias em níveis independentes. Isso possibilitará a implementação segura de um banco de dados relacionai, organizado em níveis independentes, a ser abastecido com dados de experimentos de expressão gênica. Outra etapa do projeto é elaborar um programa que cheque as vias metabólicas nas quais cada SmAE deve estar envolvido. Desta maneira, o trabalho objetiva produzir ferramentas que permitam definir ortólogos com segurança e implementar um banco de dados com perfis de expressão gênica. A definição segura de ortólogos e a integração de dados de expressão desses ortólogos é um excelente caminho para formular novas hipóteses sobre aspectos funcionais de certos genes e suas inter-relações gênicas durante o ciclo de vida do parasita. (AU)