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Uso de machine learning e dados genômicos para melhoria de características econômicas em bovinos de leite

Processo: 20/04461-6
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Mestrado
Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2020
Data de Término da vigência: 31 de março de 2022
Área de conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Ricardo Vieira Ventura
Beneficiário:Lucas Tassoni Andrietta
Instituição Sede: Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia (FMVZ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Genômica   Melhoramento genético animal   Inteligência artificial   Aprendizado computacional   Bovinos leiteiros
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Bovinos Leiteiros | Genômica | Inteligência Artificial | machine learning | Genômica

Resumo

Estratégias de acasalamento dirigido são consideradas ferramentas essenciais em programas de melhoramento animal, desempenhando importante papel como forma de se alcançar progresso genético. Com o advento da Seleção Genômica, na última década, em associação aos avanços nas técnicas reprodutivas, nota-se a diminuição no intervalo de gerações,aumentos na acurácia de predição e na intensidade de seleção, proporcionando expressivo ganho genético para os animais das cadeias produtivas. Condições essas, que revolucionaram a maneira em se selecionar animais reprodutores, refletindo na melhoria de características associadas à produção de leite e aspectos de saúde em bovinos leiteiros. Algumas facetas negativas, como a diminuição da diversidade genética e o aumento da endogamia podem ser observadas em raças sob pressão de seleção. A fim de se otimizar acasalamentos, visando a manutenção da diversidade associada ao progresso genético, ferramentas de inteligência artificial podem ser uma alternativa aos métodos lineares tradicionais. O uso de algoritmos não lineares de Machine Learning e a respectiva capacidade de detecção de padrões não tradicionais pode melhorar o direcionamento de acasalamentos, impactando desta forma em importantes características econômicas em bovinos leiteiros. (AU)

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Publicações científicas (4)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
SOUZA, ANDRE MOREIRA; SANTOS WEIGERT, RODRIGO DE ANDRADE; MACHADO DE SOUSA, ELAINE PARROS; ANDRIETTA, LUCAS TASSONI; VENTURA, RICARDO VIEIRA. Practical implications of using non-relational databases to store large genomic data files and novel phenotypes. JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS, v. 139, n. 1, . (20/04461-6, 16/19514-2)
SELLI, ALANA; VENTURA, RICARDO V.; FONSECA, PABLO A. S.; BUZANSKAS, MARCOS E.; ANDRIETTA, LUCAS T.; BALIEIRO, JULIO C. C.; BRITO, LUIZ F.. Detection and Visualization of Heterozygosity-Rich Regions and Runs of Homozygosity in Worldwide Sheep Populations. ANIMALS, v. 11, n. 9, . (16/19514-2, 20/04461-6)
PINTO, DIOGENES LODI; SELLI, ALANA; TULPAN, DAN; ANDRIETTA, LUCAS TASSONI; GARBOSSA, POLLYANA LEITE MATIOLI; VANDER VOORT, GORDON; MUNRO, JASPER; MCMORRIS, MIKE; ALVES, ANDERSON ANTONIO CARVALHO; CARVALHEIRO, ROBERTO; et al. Image feature extraction via local binary patterns for marbling score classification in beef cattle using tree-based algorithms. LIVESTOCK SCIENCE, v. 267, p. 10-pg., . (20/04461-6, 16/19514-2, 21/11156-8)
ALVES, ANDERSON ANTONIO CARVALHO; ANDRIETTA, LUCAS TASSONI; LOPES, RAFAEL ZINNI; BUSSIMAN, FERNANDO OLIVEIRA; FONSECA E SILVA, FABYANO; CARVALHEIRO, ROBERTO; BRITO, LUIZ FERNANDO; BALIEIRO, JULIO CESAR DE CARVALHO; ALBUQUERQUE, LUCIA GALVAO; VENTURA, RICARDO VIEIRA. Integrating Audio Signal Processing and Deep Learning Algorithms for Gait Pattern Classification in Brazilian Gaited Horses. FRONTIERS IN ANIMAL SCIENCE, v. 2, p. 19-pg., . (16/19514-2, 20/04461-6)
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
ANDRIETTA, Lucas Tassoni. Uso de Machine Learning e dados genômicos para melhoria de características econômicas em bovinos de leite. 2022. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia (FMVZ/SBD) Pirassununga.