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MMEC: Multi-Modal Ensemble Classifier for Protein Secondary Structure Prediction

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Autor(es):
de Oliveira, Gabriel Bianchin ; Pedrini, Helio ; Dias, Zanoni
Número total de Autores: 3
Tipo de documento: Artigo Científico
Fonte: COMPUTER ANALYSIS OF IMAGES AND PATTERNS, CAIP 2021, PT 1; v. 13052, p. 10-pg., 2021-01-01.
Resumo

The protein secondary structure prediction is an important task with many applications, such as local folding analysis, tertiary structure prediction, and function classification. Driven by the recent success of multi-modal classifiers, new studies have been conducted using this type of method in other domains, for instance, biology and health care. In this work, we investigate the ensemble of three different classifiers for protein secondary structure prediction. Each classifier of our method deals with a transformation of the original data into a specific domain, such as image classification, natural language processing, and time series tasks. As a result, each classifier achieved competitive results compared to the literature, and the ensemble of the three different classifiers obtained 77.9% and 73.3% of Q8 accuracy on the CB6133 and CB513 datasets, surpassing state-of-the-art approaches in both scenarios. (AU)

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Beneficiário:Anderson de Rezende Rocha
Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
Processo FAPESP: 15/11937-9 - Investigação de problemas difíceis do ponto de vista algorítmico e estrutural
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Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
Processo FAPESP: 19/20875-8 - Classificação de imagens de radiografias de tórax utilizando redes neurais profundas
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Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado