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Phylogenomics of the catfish family Pimelodidae with focus on the genus Pimelodus support the recognition of Sorubiminae and Pimelodinae (Teleostei, Siluriformes)

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Autor(es):
Silva, Gabriel S. C. ; Rocha, Marcelo S. ; Melo, Bruno F. ; Reia, Lais ; Roxo, Fabio F. ; Sabaj, Mark H. ; Oliveira, Claudio
Número total de Autores: 7
Tipo de documento: Artigo Científico
Fonte: ZOOLOGICA SCRIPTA; v. 53, n. 5, p. 14-pg., 2024-06-08.
Resumo

Pimelodidae is a family of large-sized catfishes consisting of 116 valid species divided into 30 genera distributed in the Neotropical region. Despite recent advancements in understanding the pimelodid phylogeny, several internal relationships have remained unclear and have received limited support from various phylogenetic analyses. We provide a new genomic dataset comprising 55 species representing 25 genera of Pimelodidae and related siluriform families Aspredinidae, Auchenipteridae, Cetopsidae, Doradidae, Diplomystidae, Heptapteridae, Loricariidae, and Pseudopimelodidae. Our phylogenetic analyses support the monophyly of Pimelodidae, as well as the existence of four major lineages: the Steindachneridion clade, the Leiarius + Phractocephalus clade, and two major subclades herein classified as Sorubiminae and Pimelodinae. Our topology resolves Phractocephalus sister to Leiarius differing from previous phylogenies. In Sorubiminae, Zungaro is sister to two large clades: one with Sorubim, Sorubimichthys, and Pseudoplatystoma, and the other with Hemisorubim, Platysilurus, Platystomatichthys, Brachyplatystoma, and Hypophthalmus. In Pimelodinae, we found the Pimelodus ornatus clade, the calophysines, and the clade with Exallodontus, Propimelodus, and Pimelodus altissimus closer to the Pimelodus group. Parapimelodus, Duopalatinus, Iheringichthys, and Bergiaria are included within the Pimelodus group. The Pimelodus group contains four main components: (1) Duopalatinus peruanus, (2) the trans-Andean Pimelodus grosskopfii; (3) Pimelodus maculatus clade with species from the Brazilian Shield in southeastern Brazil; and (4) Pimelodus blochii clade composed by species from the Amazon, Orinoco, Paran & aacute;-Paraguay, Parna & iacute;ba, S & atilde;o Francisco and coastal drainages of the Guiana Shield. The P. maculatus clade is composed by phenotypically diverse species, and the P. blochii clade houses species morphologically similar that appear nested within the widely distributed P. blochii. (AU)

Processo FAPESP: 21/12979-8 - Relações filogenéticas entre gêneros e famílias de Siluriformes usando elementos ultraconservados
Beneficiário:Gabriel de Souza da Costa e Silva
Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Processo FAPESP: 20/13433-6 - Filogenia e identificação molecular de peixes da superordem Ostariophysi (Chordata: Actinopterygii) utilizando abordagens genômicas
Beneficiário:Claudio de Oliveira
Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
Processo FAPESP: 16/11313-8 - Filogenia da Ordem Characiformes (Teleostei: Ostariophysi) utilizando elementos ultraconservados
Beneficiário:Bruno Francelino de Melo
Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Processo FAPESP: 23/09902-9 - Relações filogenéticas de Stevardiinae com ênfase na tribo Diapomini (Characiformes: Characidae) utilizando os elementos ultraconservados do genoma
Beneficiário:Lais Reia
Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Fixação de Jovens Doutores
Processo FAPESP: 22/13025-0 - Filogenia molecular de Siluroidei utilizando os elementos ultraconservados
Beneficiário:Gabriel de Souza da Costa e Silva
Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
Processo FAPESP: 14/26508-3 - Filogenia da hiperdiversa ordem Characiformes (Teleostei: Ostariophysi) utilizando elementos ultraconservados
Beneficiário:Claudio de Oliveira
Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático