Mapping Thrombosis Serum Markers by ¹H-NMR Allied with Machine Learning Tools

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Martins, Lucas G. ; Manzini, Bruna M. ; Montalvao, Silmara ; Honorato, Millene A. ; Colella, Marina P. ; Hayakawa, Gabriela G. Y. ; de Paula, Erich V. ; Orsi, Fernanda A. ; Braga, Erik S. ; Avramovic, Natasa ; Omage, Folurunsho Bright ; Tasic, Ljubica ; Annichino-Bizzacchi, Joyce M.

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: Molecules; v. 29, n. 24, p. 15-pg., 2024-12-01.

Resumo

Machine learning and artificial intelligence tools were used to investigate the discriminatory potential of blood serum metabolites for thromboembolism and antiphospholipid syndrome (APS). 1H-NMR-based metabonomics data of the serum samples of patients with arterial or venous thromboembolism (VTE) without APS (n = 32), thrombotic primary APS patients (APS, n = 32), and healthy controls (HCs) (n = 32) were investigated. Unique metabolic profiles between VTE and HCs, APS and HCs, and between VTE and triple-positive APS groups were indicative of the significant alterations in the metabolic pathways of glycolysis, the TCA cycle, lipid metabolism, and branched-chain amino acid (BCAA) metabolism, and pointed to the complex pathogenesis mechanisms of APS and VTE. Histidine, 3-hydroxybutyrate, and threonine were shown to be the top three metabolites with the most substantial impact on model predictions, suggesting that these metabolites play a pivotal role in distinguishing among APS, VTE, and HCs. These metabolites might be potential biomarkers to differentiate APS and VTE patients. (AU)

• Processo FAPESP: 21/07212-0 - Análises metabolômicas e metabonômicas por técnicas de ressonância magnética nuclear aplicadas em estudos da Trombose Venosa
• Beneficiário: Bruna Maria Manzini
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 16/14172-6 - Investigação de aspectos fisiopatológicos e novas abordagens terapêuticas em doenças tromboembólicas
• Beneficiário: Joyce Maria Annichino-Bizzacchi
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Processo FAPESP: 23/02691-2 - Exosítios de proteínas,sítios crípticos e moonlighting: identificação, mapeamento funcional e efeitos de alteração estrutural
• Beneficiário: Folorunsho Bright Omage
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 14/50867-3 - INCT 2014: Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Bioanalítica
• Beneficiário: Marco Aurelio Zezzi Arruda
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Processo FAPESP: 18/24069-3 - Do biomonitoramento ao reconhecimento de assinaturas do exposoma humano visando antecipar riscos para uma saúde contínua
• Beneficiário: Fernando Barbosa Júnior
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático