Microbial community of cultivated and uncultivated citrus rhizosphere microbiota in Brazil

Autor(es)

Lima, Helena Santiago ; Mancine, Nathalia ; Peruchi, Giovana Betin ; Francisco, Carolina Sardinha ; Wang, Nian ; de Souza, Rafael Soares Correa ; Armanhi, Jaderson Silveira Leite ; Coletta-Filho, Helvecio Della

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: SCIENTIFIC DATA; v. 11, n. 1, p. 8-pg., 2024-11-27.

Resumo

The rhizosphere microbiome is known to contain beneficial microorganisms that promote plant growth and increase tolerance to abiotic and biotic stresses. Understanding citrus microbiome diversity and the percentage of diversity that can be recovered in the laboratory is essential for developing innovative approaches to improve plant health and promote sustainable agricultural practices. However, information about the citrus root microbiome, especially in the context of exploring commercial citrus growing areas to identify beneficial plant growth-promoting rhizobacteria (PGPR), is scarce. Here, we present the microbiome data of healthy citrus trees sampled from geographical regions of S & atilde;o Paulo and Amazonas States, in Brazil. The resulting rhizosphere microbiome data comprise an average of 126,180 and 138,707 high-quality reads for the 16S rRNA V3-V4 and ITS1-5F regions, respectively. The taxonomic analysis of cultivated diversity revealed a total of 91 bacterial genera recovered in the laboratory. These data provide valuable information for understanding how the microbiome supports citrus plants in different environments and for developing new strategies to improve crop productivity by using PGPR. (AU)

• Processo FAPESP: 20/14584-8 - Comunidades sintéticas da microbiota da rizosfera de citros visando benefícios ao desenvolvimento da planta e resistência a estresses
• Beneficiário: Helvecio Della Coletta Filho
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Processo FAPESP: 23/13314-5 - Explorando a microbiota rizosférica do porta-enxerto Citrumelo Swingle em campo sob condições de estresse hídrico
• Beneficiário: Giovana Betin Peruchi
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Processo FAPESP: 23/03131-0 - Identificação e seleção de comunidades sintéticas estabelecidas de rizobactérias de plantas cítricas
• Beneficiário: Helena Santiago Lima
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 23/01392-1 - Caracterização de populações de rizobactérias de citros sob sistemas de cultivo orgânico e convencional
• Beneficiário: Nathália Mancine
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado