| Texto completo | |
| Autor(es): |
Costa, Gabriela O.
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Nobile, Andre B.
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Morales, Bruno F.
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Rossini, Bruno C.
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Souza, Diogo Freitas
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Freitas, Erica A. Serrano
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Oliveira, Claudio
Número total de Autores: 7
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| Tipo de documento: | Artigo Científico |
| Fonte: | Neotropical Ichthyology; v. 23, n. 3, p. 23-pg., 2025-01-01. |
| Resumo | |
The alarming increase in the number of threatened species underscores the urgent need for more effective conservation strategies. In this context, advancements in molecular techniques and high-throughput sequencing have been instrumental in providing faster and more precise approaches for biodiversity assessment compared to traditional methodologies. DNA metabarcoding facilitates the simultaneous identification of multiple species from pooled genomic DNA samples using universal primers. To address the limitation of short-read sequences, we developed a novel primer set that, in combination with existing primers, enables the assembly of long COI gene sequences through read overlap. This study compares the efficacy of DNA barcoding and metabarcoding in ichthyoplankton samples, focusing on their capacity for species recovery. Using similar samples, DNA barcoding identified 40 taxa, whereas DNA metabarcoding identified 47 taxa. These findings highlight the potential of DNA metabarcoding as a robust approach for ichthyoplankton community analysis, offering extensive species-level data at reduced costs and establishing it as a valuable tool for biodiversity conservation and management initiatives. (AU) | |
| Processo FAPESP: | 15/19025-9 - Identificação de áreas prioritárias à conservação de espécies ameaçadas no rio Mogi-Guaçu utilizando técnicas de DNA barcode |
| Beneficiário: | André Batista Nobile |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado |
| Processo FAPESP: | 19/03597-4 - Uso do DNA metabarcoding na identificação de áreas prioritárias à conservação da ictiofauna Neotropical |
| Beneficiário: | Gabriela Omura da Costa |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Mestrado |
| Processo FAPESP: | 20/13433-6 - Filogenia e identificação molecular de peixes da superordem Ostariophysi (Chordata: Actinopterygii) utilizando abordagens genômicas |
| Beneficiário: | Claudio de Oliveira |
| Modalidade de apoio: | Auxílio à Pesquisa - Temático |
| Processo FAPESP: | 17/12758-6 - Uso de DNA metabarcoding como ferramenta alternativa, resolutiva e de baixo custo ao DNA barcoding em estudos do ictioplâncton |
| Beneficiário: | André Batista Nobile |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado |