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Numts em Meliponini (Hymenoptera: Apidae): prospecção genômica, origem e evolução

Processo: 14/25023-6
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de março de 2015
Data de Término da vigência: 30 de junho de 2017
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
Acordo de Cooperação: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
Pesquisador responsável:Maria Cristina Arias
Beneficiário:Elaine Aparecida Françoso
Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Apidae   Genoma mitocondrial   Meliponini
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Apidae | Genoma mitocondrial | Meliponini | NUMTs | Pseudogene | Sequenciamento de última geração | Genética e evolução de abelhas

Resumo

Numts são cópias não funcionais de genes de origem mitocondrial presentes no genoma nuclear. Essas regiões têm sido acidentalmente reconhecidas em diversos organismos pela presença de indels e stop códons em suas sequências. Em Meliponini, numts foram descritos em três espécies, e nossos resultados preliminares comprovaram a presença desses pseudogenes em outras três. O objetivo principal desse projeto é estudar os numts dentro de um contexto evolutivo. Pretende-se testar a hipótese de que os numts encontrados até agora em Meliponini são exclusivos dessa tribo, ou alternativamente, se a origem é mais basal dentro do grupo das abelhas corbiculadas. Para isso, espécies de Meliponini que representem toda a tribo e espécies de abelhas corbiculadas serão analisadas. Os genomas nuclear e mitocondrial serão isolados e utilizando-se de sondas dos genes mitocondriais, será possível isolar as cópias mitocondriais presentes no núcleo. Assim, os genes mitocondriais e seus respectivos numts serão caracterizados para entender onde e quando, num contexto evolutivo, os eventos de formação dos numts ocorreram.Numts podem ser ao mesmo tempo um obstáculo e uma nova ferramenta para análises evolutivas. Entender a origem e evolução desses pseudogenes será importante não só para o grupo econômica e ecologicamente importante das abelhas corbiculadas, mas também para diversos estudos que usam genes mitocondriais como principais marcadores moleculares, como em análises filogenéticas, filogeográficas, genética de população e identificação molecular de espécies por DNA barcode. (AU)

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Publicações científicas (4)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
FRANCOSO, ELAINE; ZUNTINI, ALEXANDRE RIZZO; RICARDO, PAULO CSERI; NALDI SILVA, JOAO PAULO; BRITO, RUTE; OLDROYD, BENJAMIN P.; ARIAS, MARIA CRISTINA. Conserved numts mask a highly divergent mitochondrial-COI gene in a species complex of Australian stingless bees Tetragonula (Hymenoptera: Apidae). MITOCHONDRIAL DNA PART A, v. 30, n. 7, p. 806-817, . (16/24669-5, 14/25023-6)
FRANCOSO, ELAINE; ZUNTINI, ALEXANDRE RIZZO; RICARDO, PAULO CSERI; ARAUJO, NATALIA DE SOUZA; SILVA, JOAO PAULO NALDI; BROWN, MARK J. F.; ARIAS, MARIA CRISTINA. The complete mitochondrial genome of Trigonisca nataliae (Hymenoptera, Apidae) assemblage reveals heteroplasmy in the control region. Gene, v. 881, p. 7-pg., . (14/25023-6, 16/24669-5)
FRANCOSO, ELAINE; ZUNTINI, ALEXANDRE RIZZO; RICARDO, PAULO CSERI; SANTOS, PRISCILA KARLA FERREIRA; ARAUJO, NATALIA DE SOUZA; SILVA, JOAO PAULO NALDI; GONCALVES, LEONARDO TRESOLDI; BRITO, RUTE; GLOAG, ROSALYN; TAYLOR, BENJAMIN A.; et al. Rapid evolution, rearrangements and whole mitogenome duplication in the Australian stingless bees Tetragonula (Hymenoptera: Apidae): A steppingstone towards understanding mitochondrial function and evolution. International Journal of Biological Macromolecules, v. 242, p. 9-pg., . (14/25023-6, 16/24669-5)
RICARDO, PAULO CSERI; FRANCOSO, ELAINE; ARIAS, MARIA CRISTINA. Mitochondrial DNA intra-individual variation in a bumblebee species: A challenge for evolutionary studies and molecular identification. MITOCHONDRION, v. 53, p. 243-254, . (16/24669-5, 14/25023-6, 13/12530-4)