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Herança da resposta ao estresse hídrico em uma monocotiledônea com fotossíntese C4: mecanismos genéticos e epigenéticos e o papel dos elementos de transposição

Processo: 15/16975-6
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Regular
Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2015
Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2017
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
Pesquisador responsável:Nathalia de Setta Costa
Beneficiário:Nathalia de Setta Costa
Instituição Sede: Centro de Ciências Naturais e Humanas (CCNH). Universidade Federal do ABC (UFABC). Ministério da Educação (Brasil). Santo André , SP, Brasil
Pesquisadores associados:Danilo da Cruz Centeno ; Eduardo Leite Borba ; Marcos Silveira Buckeridge ; Maria Magdalena Rossi
Assunto(s):Epigênese genética  Estresse hídrico  Genômica  Elementos de DNA transponíveis  Setaria italica 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:elementos de transposição | epigenética | Estresse Hídrico | Genômica Funcional | Herança Transgeracional | Setaria italica | Genômica da resposta ao estresse

Resumo

Evolução e Fisiologia se desenvolveram como disciplinas separadas, o que refletiu em uma hipótese de que ambas só poderiam ser estudadas de forma desassociada. Nesse projeto, propomos investigar um problema clássico da fisiologia vegetal com um olhar evolutivo para buscar respostas sobre os mecanismos que regem a herança da plasticidade fenotípica. Como os elementos de transposição têm sido repetidamente associados à geração de variabilidade genética e epigenética em plantas, o objetivo desse projeto será avaliar o papel dessas sequências na geração e herança da resposta plástica ao estresse hídrico em monocotiledôneas C4. Propõe-se utilizar Setaria italica como espécie modelo devido à facilidade de cultivo e a disponibilidade do genoma sequenciado. Será realizado um experimento em casa de vegetação em que plantas serão cultivadas por duas gerações em um gradiente de estresse hídrico. Plantas dos diferentes tratamentos serão comparadas quanto à sobrevivência e reprodução, por meio da avaliação de caracteres de fitness, e amostras de folhas e sementes serão analisadas por meio de perfis metabólicos e de expressão gênica (mRNA, sRNAs e qPCR). Além de avaliar se os elementos de transposição desempenham um papel na regulação epigenética da tolerância à seca, os dados obtidos permitirão determinar genes e rotas metabólicas que conferem plasticidade fenotípica em S. italica. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
SUGUIYAMA, VANESSA FUENTES; BACIEGA VASCONCELOS, LUIZ AUGUSTO; ROSSI, MARIA MAGDALENA; BIONDO, CIBELE; DE SETTA, NATHALIA. The population genetic structure approach adds new insights into the evolution of plant LTR retrotransposon lineages. PLoS One, v. 14, n. 5, . (15/16975-6)
SUGUIYAMA, VANESSA FUENTES; PAREDES RODRIGUEZ, JAE DIANA; NICOMEDIO DOS SANTOS, TATIANE CRISTINA; LIRA, BRUNO SILVESTRE; DE HARO, LUIS ALEJANDRO; NALDI SILVA, JOAO PAULO; BORBA, EDUARDO LEITE; PURGATTO, EDUARDO; DA SILVA, EMERSON ALVES; BELLORA, NICOLAS; et al. Regulatory mechanisms behind the phenotypic plasticity associated with Setaria italica water deficit tolerance. Plant Molecular Biology, v. N/A, p. 20-pg., . (12/23838-7, 15/16975-6)