Análise sistemática in silico do comportamento crítico do peptídeo amiloide beta e de alguns dos seus mutantes

Resumo

Simulações de dinâmica molecular serão efetuadas para descrever estados intermediários dos peptídeos amiloide $\beta$ com 40 resíduos (A$\beta_{40}$), 42 resíduos (A$\beta_{42}$), e de um conjunto de peptídeos mutantes obtidos trocando-se pontualmente aminoácidos nas sequencias A$\beta$. Os peptídeos A$\beta$ e seus variantes mutantes desempenham um papel central na doença de Alzheimer e apresentam diferentes níveis de toxicidade e propensidade à conversão das formas solúveis em formas de agregados fibrilares insolúveis. Um ensemble de estruturas será obtido com simulações de dinâmica molecular com o programa computacional GROMACS para descrever as cadeias peptídicas incluindo todos os átomos. Objetivamos a determinação das propriedades críticas e características conformacionais destes peptídeos para descrever os efeitos das mutações sobre as suas propensidades. (AU)