| Processo: | 16/04176-4 |
| Modalidade de apoio: | Auxílio à Pesquisa - Regular |
| Data de Início da vigência: | 01 de junho de 2016 |
| Data de Término da vigência: | 31 de maio de 2018 |
| Área do conhecimento: | Ciências Exatas e da Terra - Física - Física da Matéria Condensada |
| Pesquisador responsável: | Nelson Augusto Alves |
| Beneficiário: | Nelson Augusto Alves |
| Instituição Sede: | Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil |
| Município da Instituição Sede: | Ribeirão Preto |
| Assunto(s): | Simulação de dinâmica molecular Biofísica |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | amiloide beta | Dinâmica Molecular | estados intermediarios | Gromacs | variantes Abeta | Biofisica molecular |
Resumo
Simulações de dinâmica molecular serão efetuadas para descrever estados intermediários dos peptídeos amiloide $\beta$ com 40 resíduos (A$\beta_{40}$), 42 resíduos (A$\beta_{42}$), e de um conjunto de peptídeos mutantes obtidos trocando-se pontualmente aminoácidos nas sequencias A$\beta$. Os peptídeos A$\beta$ e seus variantes mutantes desempenham um papel central na doença de Alzheimer e apresentam diferentes níveis de toxicidade e propensidade à conversão das formas solúveis em formas de agregados fibrilares insolúveis. Um ensemble de estruturas será obtido com simulações de dinâmica molecular com o programa computacional GROMACS para descrever as cadeias peptídicas incluindo todos os átomos. Objetivamos a determinação das propriedades críticas e características conformacionais destes peptídeos para descrever os efeitos das mutações sobre as suas propensidades. (AU)
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