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Seleção assistida por marcadores moleculares e genotipagem por sequenciamento (GBS) visando à resistência à mancha angular em feijão comum

Processo: 17/01753-3
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Mestrado
Data de Início da vigência: 01 de julho de 2017
Data de Término da vigência: 31 de outubro de 2019
Área de conhecimento:Ciências Agrárias - Agronomia - Fitotecnia
Acordo de Cooperação: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
Pesquisador responsável:Luciana Lasry Benchimol-Reis
Beneficiário:Caléo Panhoca de Almeida
Instituição Sede: Instituto Agronômico (IAC). Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Secretaria de Agricultura e Abastecimento (São Paulo - Estado). Campinas , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):18/15526-1 - Estudo de associação genômica ampla para identificação de locus de interesse agronômico em feijão comum, BE.EP.MS
Assunto(s):Melhoramento genético vegetal   Feijoeiro   Resistência à doença   Doenças de plantas   Mancha angular   Técnicas de genotipagem   Marcador molecular   Fatores bióticos
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Estresse biótico | Feijoeiro comum | mancha angular | resistência genética | marcadores moleculares

Resumo

A mancha-angular (ALS) é uma doença do feijoeiro que podem causar redução na produção e na qualidade dos grãos produzidos, e frente a variabilidade do patógeno, a resistência duradoura não foi alcançada ainda. Por estudos de nosso grupo, esta doença mostrou padrão quantitativo de resistência genética e vários QTLs devem ser introgredidos para produzir uma resistência duradoura. A técnica de AB-QTL (Advanced Backcross QTL Analysis) visa a selecionar, introgredir e mapear simultaneamente os QTLs, via retrocruzamentos, de tal forma a que os efeitos (epistáticos e pleiotrópicos) da combinação dos diferentes QTLs possam ser mensurados, e apenas o QTLs favoráveis sejam transferidos, sem se perder a qualidade do cultivar elite que será utilizado como parental recorrente. Enquanto as outras metodologias de seleção assistida se baseiam em primeiro realizar o mapeamento de QTLs para em seguida se transferir alelos favoráveis, esta técnica propõe que as progênies e/ou linhagens sejam avaliadas fenotipicamente simultaneamente com a introgressão dos QTLs, diminuindo-se o problema do linkage drag e as interações negativas. A seleção fenotípica elimina as progênies com desempenho inferior, mesmo aquelas que possuam os QTLs favoráveis introgredidos, mas que podem ter os seus valores genéticos alterados pelas interações epistáticas, efeitos pleiotrópicos ou pela interação genótipos x ambiente. O objetivo deste projeto é o de utilizar a técnica de AB-QTL para promover um ganho de resistência genética à ALS no programa de melhoramento do feijoeiro do IAC. Um programa de retrocruzamento vem sendo conduzido desde 2014 para resistência à mancha angular, onde a cultivar IAC Milênio (suscetível, parental recorrente) foi cruzada com a cultivar AND 277 (resistente, parental doador). Seleção fenotípica para eliminação das plantas fora de tipo ´carioca´ foi efetuada em F2RC22, e a avaliação de marcadores moleculares em grande escala ocorrerá em F3RC22 com SNPs gerados e genotipados através da plataforma GBS. Nesta geração, os QTLs serão mapeados e as linhagens quase isogênicas (QTL-NILs) avaliadas. A fenotipagem para esta doença será feita em casa de vegetação, com repetições. Espera-se que novas cultivares possam ser recomendadas no programa de melhoramento do feijoeiro do IAC e que as mesmas mostrem resistência efetiva em condições de plantio. (AU)

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Publicações científicas (9)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
ALMEIDA, CALEO PANHOCA DE; PAULINO, JEAN FAUSTO DE CARVALHO; MORAIS CARBONELL, SERGIO AUGUSTO; CHIORATO, ALISSON FERNANDO; SONG, QIJIAN; DI VITTORI, VALERIO; RODRIGUEZ, MONICA; PAPA, ROBERTO; BENCHIMOL-REIS, LUCIANA LASRY. Genetic Diversity, Population Structure, and Andean Introgression in Brazilian Common Bean Cultivars after Half a Century of Genetic Breeding. GENES, v. 11, n. 11, . (17/01753-3, 17/24711-4, 19/19670-2, 18/15526-1)
DE ALMEIDA, CALEO PANHOCA; PAULINO, JEAN FAUSTO DE CARVALHO; SANTOS, ISABELLA LAPORTE; BAJAY, MIKLOS MAXIMILIANO; GONCALVES, JOAO GUILHERME RIBEIRO; CARVALHO, CASSIA REGINA LIMONTA; CARBONELL, SERGIO AUGUSTO MORAIS; CHIORATO, ALISSON FERNANDO; BENCHIMOL-REIS, LUCIANA LASRY. Marker-assisted backcrossing for disease resistance and agronomic traits in Carioca beans. CROP SCIENCE, v. 61, n. 4, p. 2510-2521, . (14/11145-2, 17/01753-3)
DE CARVALHO PAULINO, JEAN FAUSTO; DE ALMEIDA, CALEO PANHOCA; BUENO, CESAR JUNIOR; SONG, QIJIAN; FRITSCHE-NETO, ROBERTO; MORAIS CARBONELL, SERGIO AUGUSTO; CHIORATO, ALISSON FERNANDO; BENCHIMOL-REIS, LUCIANA LASRY. Genome-Wide Association Study Reveals Genomic Regions Associated with Fusarium Wilt Resistance in Common Bean. GENES, v. 12, n. 5, . (19/19670-2, 18/15526-1, 17/01753-3, 17/24711-4)
DE CARVALHO PAULINO, JEAN FAUSTO; DE ALMEIDA, CALEO PANHOCA; FERRARI BARBOSA, CAIO CESAR; DE MORAES, GABRIEL; GONCALVES, CUNHA; BUENO, CESAR JUNIOR; HARAKAVA, RICARDO; MORAIS CARBONELL, SERGIO AUGUSTO; CHIORATO, ALISSON FERNANDO; BENCHIMOL-REIS, LUCIANA LASRY. Molecular and pathogenicity characterization of Fusarium oxysporum species complex associated with Fusarium wilt of common bean in Brazil. ROPICAL PLANT PATHOLOG, v. N/A, p. 10-pg., . (17/24711-4, 17/01753-3, 18/15526-1, 19/19670-2)
DE CARVALHO PAULINO, JEAN FAUSTO; DE ALMEIDA, CALEO PANHOCA; SANTOS, ISABELLA LAPORTE; RIBEIRO GONCALVES, JOAO GUILHERME; MORAIS CARBONELL, SERGIO AUGUSTO; CHIORATO, ALISSON FERNANDO; BENCHIMOL-REIS, LUCIANA LASRY. Combining disease resistance and postharvest quality traits by early marker-assisted backcrossing in carioca beans. Scientia Agricola, v. 79, n. 2, . (14/11145-2, 17/01753-3)
DE ALMEIDA, CALEO PANHOCA; ARRUDA, NATALIA; DE CARVALHO PAULINO, JEAN FAUSTO; DE FREITAS, GABRIEL MAMEDIO; JANINI BONFANTE, GABRIEL FRANCESCO; BAJAY, MIKLOS MAXIMILIANO; DE DEUS, BIANCA CRISTINA; ALVES PATRICIO, FLAVIA RODRIGUES; MORAIS CARBONELL, SERGIO AUGUSTO; CHIORATO, ALISSON FERNANDO; et al. Genetic diversity ofPseudocercospora griseolaresistancelociin common beans. ROPICAL PLANT PATHOLOG, v. 46, n. 1, p. 10-pg., . (14/19967-1, 14/11145-2, 17/01753-3)
DE ALMEIDA, CALEO PANHOCA; ARRUDA, NATALIA; DE CARVALHO PAULINO, JEAN FAUSTO; DE FREITAS, GABRIEL MAMEDIO; JANINI BONFANTE, GABRIEL FRANCESCO; BAJAY, MIKLOS MAXIMILIANO; DE DEUS, BIANCA CRISTINA; ALVES PATRICIO, FLAVIA RODRIGUES; MORAIS CARBONELL, SERGIO AUGUSTO; CHIORATO, ALISSON FERNANDO; et al. Genetic diversity ofPseudocercospora griseolaresistancelociin common beans. TROPICAL PLANT PATHOLOGY, v. 46, n. 1, . (17/01753-3, 14/19967-1, 14/11145-2)
ALMEIDA, CALEO PANHOCA DE; DE CARVALHO PAULINO, JEAN FAUSTO; BONFANTE, GABRIEL FRANCESCO JANINI; PERSEGUINI, JULIANA MORINI KUPPER CARDOSO; SANTOS, ISABELLA LAPORTE; GONCALVES, JOAO GUILHERME RIBEIRO; PATRICIO, FLAVIA RODRIGUES ALVES; TANIGUTI, CRISTIANE HAYUMI; GESTEIRA, GABRIEL DE SIQUEIRA; GARCIA, ANTONIO AUGUSTO FRANCO; et al. Angular Leaf Spot Resistance Loci Associated With Different Plant Growth Stages in Common Bean. FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, v. 12, . (18/20992-1, 18/15526-1, 19/19670-2, 14/11145-2, 17/24711-4, 17/01753-3, 14/08280-5)
DE CARVALHO PAULINO, JEAN FAUSTO; DE ALMEIDA, CALEO PANHOCA; SONG, QIJIAN; CARBONELL, SERGIO AUGUSTO MORAIS; CHIORATO, ALISSON FERNANDO; BENCHIMOL-REIS, LUCIANA LASRY. Genetic diversity and inter-gene pool introgression of Mesoamerican Diversity Panel in common beans. JOURNAL OF APPLIED GENETICS, v. 62, n. 4, . (19/19670-2, 18/15526-1, 17/01753-3, 17/24711-4)