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Otimização do desempenho de produção em bovinos de corte compostos através do uso de abordagens genômicas alternativas

Processo: 18/20393-0
Modalidade de apoio:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
Data de Início da vigência: 28 de janeiro de 2019
Data de Término da vigência: 27 de janeiro de 2020
Área de conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:José Bento Sterman Ferraz
Beneficiário:Laís Grigoletto
Supervisor: Luiz Fernando Brito
Instituição Sede: Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos (FZEA). Universidade de São Paulo (USP). Pirassununga , SP, Brasil
Instituição Anfitriã: Purdue University, Estados Unidos  
Vinculado à bolsa:17/11919-6 - Aplicação de estratégias de estudos genômicos para características produtivas em bovinos Montana Composto Tropical®, BP.DR
Assunto(s):Seleção genômica   Vigor híbrido   Carne bovina   Qualidade da carne   Bovinos de corte   Variação genética
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:composite beef cattle | Genomic prediction | Heterosis | Imputation | production | Seleção Genômica

Resumo

A produção de carne bovina é um componente importante da economia brasileira e coloca o país entre os maiores produtores e exportadores mundiais de carne bovina. O desenvolvimento e uso de populações compostas representam uma alternativa promissora para aumentar a eficiência e a qualidade da produção em bovinos de corte. A combinação estratégica de diferentes raças representa uma grande oportunidade para maximizar a variabilidade genética e explorar a heterose e a complementaridade entre as raças. A fim de implementar com sucesso as avaliações genômicas para populações compostas, várias abordagens e metodologias genômicas precisam ser investigadas. Por exemplo, o uso de informação de haplótipos e a incorporação de efeitos aditivos e não-aditivos nos modelos de avaliação genômica. Além disso, a maioria dos modelos genômicos e métodos atualmente utilizados para avaliações genômicas foram desenvolvidos com base em animais de raça pura e o conhecimento sobre o uso de informações genômicas em raças de gado sintéticas ou compostas ainda é muito limitado. Portanto, estudos que investigam metodologias mais sofisticadas e abordagens genômicas permitirão um uso mais eficiente da informação genômica disponível para raças compostas e, conseqüentemente, valores genéticos mais precisos. Este projeto faz parte de um projeto temático apoiado pela FAPESP (Processo 2014/07566-2), também uma parte importante do projeto em desenvolvimento no Brasil (Processo 2017/11919-6). Os objetivos gerais são investigar metodologias de seleção genômica e estratégias de imputação para melhorar a precisão da predição genômica de valores genéticos na população geneticamente diversa de Montana Tropical®. As características incluídas neste estudo serão: peso ao nascer, peso à desmama, peso aos 12 meses, circunferência escrotal (como indicador do desempenho na fertilidade) e musculatura aos 14 meses. Um total de 2.000 genótipos de alta densidade de animais de várias raças (Montana, Nelore, Aberdeen Angus, Belmont Red, Bonsmara, Charolês, Devon, Hereford, Braunvieh, Limousin, Red Angus, Senepol e Simental) estão atualmente disponíveis para esta pesquisa. As análises de imputação serão realizadas utilizando o software FImpute 2.2 e Beagle 4.1. As predições genômicas serão realizadas utilizando diferentes metodologias (GBLUP, Bayes LASSO, CÀ, R e Bayesian single-step) e estratégias para definir as populações de treinamento, com base em resultados de diversidade genética e análises de estrutura populacional. Em resumo, este projeto contribuirá para o desenvolvimento de métodos genômicos e abordagens para o progresso genético de fixadores para uma variedade de características economicamente importantes em bovinos de corte compostos e aumentará a lucratividade dos produtores de carne bovina.

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
GRIGOLETTO, LAIS; BRITO, LUIZ FERNANDO; MATTOS, ELISANGELA C.; ELER, JOANIR PEREIRA; BUSSIMAN, FERNANDO OLIVEIRA; ABREU SILVA, BARBARA DA CONCEICAO; DA SILVA, ROSIANE PEREIRA; CARVALHO, FELIPE EGUTI; BERTON, MARIANA PIATTO; BALDI, FERNANDO; et al. Genome-wide associations and detection of candidate genes for direct and maternal genetic effects influencing growth traits in the Montana Tropical (R) Composite population. LIVESTOCK SCIENCE, v. 229, p. 64-76, . (17/11919-6, 18/20393-0, 14/07566-2)
GRIGOLETTO, LAIS; FERRAZ, JOSE B. S.; OLIVEIRA, HINAYAH R.; ELER, JOANIR P.; BUSSIMAN, FERNANDO O.; ABREU SILVA, BARBARA C.; BALDI, FERNANDO; BRITO, LUIZ F.. Genetic Architecture of Carcass and Meat Quality Traits in Montana Tropical (R) Composite Beef Cattle. FRONTIERS IN GENETICS, v. 11, . (14/07566-2, 18/20393-0, 17/11919-6)