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Caracterização da inativação de sequências autossômicas em indivíduos com translocações X-autossomo não equilibradas

Processo: 20/16422-5
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de junho de 2021
Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2025
Área de conhecimento:Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
Pesquisador responsável:Maria Isabel de Souza Aranha Melaragno
Beneficiário:Bianca Pereira Favilla
Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:19/21644-0 - Impacto de variantes genéticas na estabilidade do genoma e seus efeitos no fenótipo, AP.TEM
Bolsa(s) vinculada(s):23/01147-7 - Investigação de mecanismos mediadores do silenciamento e escape na inativação do cromossomo X, BE.EP.DR
Assunto(s):Genética médica   Cromossomo X   Inativação do cromossomo X   Translocação genética   Microdissecção   Metilação de DNA   Expressão gênica   Análise de sequência de RNA
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:cromossomo X | Inativação cromossômica | Metilação do DNA | microdissecção cromossômica | sequenciamento de RNA | Translocação não equilibrada | Genética Humana

Resumo

Rearranjos envolvendo o cromossomo X apresentam peculiaridades em decorrência da inativação não casual do cromossomo X, sendo que nos casos de translocações X-autossomo não equilibradas, a Inativação do Cromossomo X (ICX) ocorre preferencialmente no cromossomo alterado. Nos raros casos de derivados do cromossomo X contendo o centro de inativação e sequências de cromossomos autossomos, pode haver inativação dessas sequências autossômicas além das do cromossomo X. Nesses casos, a propagação da ICX para sequências autossômicas pode ter impacto fenotípico direto, a depender dos genes que são inativados. Há poucos estudos que analisaram o perfil de metilação do DNA e expressão de genes autossômicos nesses casos, nenhum deles realizando análises comparando diretamente cromossomos translocados e seus homólogos normais do mesmo paciente quanto aos níveis de metilação do DNA e expressão de todos os genes envolvidos nas translocações. No presente trabalho, a caracterização da propagação da inativação do cromossomo X para sequências autossômicas em pacientes com translocações X-autossomo não equilibradas será realizada pela análise de metilação cromossomo-específica comparando-se os dados de sequenciamento com bissulfito de sódio dos cromossomos autossomos translocados e de seus homólogos normais, obtidos por microdissecção cromossômica, além da análise de expressão gênica alelo-específica por RNA-seq. Serão avaliados ainda, in silico, elementos de DNA e a organização dos domínios topologicamente associados (TADs) nas regiões autossômicas que possam influenciar a propagação da inativação. Os dados obtidos permitirão a caracterização cromossomo-específica do processo de propagação da ICX, auxiliando na compreensão do papel de elementos de DNA e cromatina nesse processo e das suas consequências clínicas. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
FAVILLA, BIANCA PEREIRA; AL-RIKABI, AHMED; BRUNO, DANIELLE C. F.; ASPRINO, PAULA; MELONI, VERA AYRES; GALANTE, PEDRO A. F.; LOPES-CENDES, ISCIA; BELLUCCO, FERNANDA TEIXEIRA; LIEHR, THOMAS; MELARAGNO, MARIA ISABEL. Single-chromosome methylation sequencing and gene expression data unravel spreading of X-chromosome inactivation into gene-rich autosomal regions in an unbalanced t(X;13) translocation. European Journal of Human Genetics, v. 32, p. 1-pg., . (20/16422-5)
FAVILLA, BIANCA PEREIRA; OLIVATI, CAROLINE; FREITAS, ERIKA LOPES; SANTOS, BIBIANA; MELARAGNO, MARIA ISABEL; MELONI, VERA AYRES; PIAZZON, FLAVIA BALBO. Mildly skewed X-chromosome inactivation as a mechanism for the expression of Allan-Herndon-Dudley syndrome phenotype in a female patient. European Journal of Human Genetics, v. 31, p. 1-pg., . (19/21644-0, 20/16422-5)