| Processo: | 21/10401-9 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 01 de abril de 2022 |
| Data de Término da vigência: | 28 de fevereiro de 2026 |
| Área de conhecimento: | Interdisciplinar |
| Pesquisador responsável: | Ricardo Roberto da Silva |
| Beneficiário: | Gabriel Santos Arini |
| Instituição Sede: | Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil |
| Assunto(s): | Espectrometria de massas Biologia computacional Metabolômica Microbiota Quimioinformática Sinal biológico Cromatografia líquida acoplada à espectrometria de massas |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | bioinformática | Metabolomica | Microbioma | quimioinformática | espectrometria de massas |
Resumo A metabolômica tem ganhado destaque no campo das ciências ômicas. Ela oferece a possibilidade de compreensão fenotípica a nível molecular, abrangendo diversas áreas do saber. Das abordagens experimentais baseadas em espectrometria de massas (MS), a metabolômica untargeted apresenta-se de maneira muito promissora, porque tem a capacidade de revelar novos Produtos Naturais (PN) de interesse farmacológico. Estima-se que 60% dos fármacos atualmente registrados tenham um produto natural envolvido no seu desenvolvimento. Neste sentido, o potencial de descoberta de novos bioativos a partir do microbioma marinho, pelo uso da metabolômica untargeted, é grande, dada a extensão e diversidade ambiental da costa brasileira. Apesar dos avanços tecnológicos, proporcionando uma cobertura mais ampla na deteção em MS, a dificuldade na discriminação entre um sinal biológico do ruído nos dados obtidos em experimentos com abordagem untargeted, é um gargalo na aplicação da técnica para a área de PN. Neste sentido, o presente projeto tem por objetivo desenvolver uma plataforma experimental robusta para distinção entre sinal biológico e ruído em MS, permitindo a criação de catálogos de espectros em comunidades microbianas marinhas. Para tanto, a partir de extratos de modelos microbianos, serão selecionados sinais biológicos reprodutíveis, para posterior detecção e fragmentação em experimentos do tipo LC-MS/MS. Serão criadas ferramentas para inspeção e seleção de espectros de alta qualidade, bem como a conexão destes aos genes anotados no sistema biológico alvo. Os resultados preliminares apresentados demonstram que se trata de um projeto exequível, viável e promissor. O projeto será desenvolvido no Laboratório de Quimio-Biologia Computacional (CCBL) e no Núcleo de Pesquisa em Produtos Naturais e Sintéticos (NPPNS), sob a supervisão do Dr. Ricardo Roberto da Silva e do Prof. Dr. Norberto Peporine Lopes. O CCBL possui um auxílio para pesquisa de Apoio a Jovens Pesquisadores (17/18922-2). Também iremos contar com o suporte do NPPNS por meio do auxílio à pesquisa Temático 2020/02207-5. Além disso, contamos com a colaboração direta da Profa. Dra. Letícia Lotufo, que irá atuar no projeto tanto com questões técnicas, quanto práticas (Temático 15/17177-6). (AU) | |
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