Predições genômicas para resistência a Aeromonas hydrophila em pacu Piaractus mesopotamicus

Resumo

O pacu Piaractus mesopotamicus é considerada uma das mais importantes espécies de peixes nativos cultivados na América do Sul, e representa uma espécie-alvo para programas de melhoramento genético. Infecções por Aeromonas hydrophila tem sido responsáveis por elevados surtos de mortalidade na aquicultura mundial, inclusive na produção de pacu. No entanto, os tratamentos contra surtos infecciosos mais utilizados na aquicultura são predominantemente baseados na aplicação impactante de antibióticos comerciais. Portanto, a seleção de genótipos superiores para resistência a doenças é fundamental para maximizar a produção animal no contexto da sustentabilidade e segurança alimentar. Portanto, o objetivo deste estudo é avaliar a habilidade de seleção genômica por meio da utilização de uma estratégia de baixo custo baseada na combinação de genotipagem por sequenciamento direcionado (tGBS), baixa densidade de SNPs, e imputação genômica. Cinquenta famílias de pacu pertencentes ao núcleo de melhoramento do Centro de Aquicultura da Unesp (CAUNESP/UNESP) e avaliadas quanto à resistência contra A. hydrophila serão utilizadas como material biológico. Posteriormente, análises de imputação genômica e predição de acurácia da imputação serão realizadas por meio de genótipos parentais obtidos por meio de um painel de média densidade previamente desenvolvido para o pacu (~30K SNPs), imputação dos genótipos na progênie utilizando um painel de baixa densidade (~1K SNPs), e abordagens de imputação baseadas na genealogia. A eficácia da seleção genômica através do painel de SNPs de baixa densidade, por meio da imputação genômica, resultará em uma estratégia economicamente viável para o desenvolvimento da seleção genômica para o pacu, e será de grande utilidade para a aplicação na seleção de genótipos superiores de pacu resistentes à A. hydrophila, o que permitirá o desenvolvimento crescente e sustentável da produção.