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Estratégias integradas para a descoberta de produtos naturais de cianobactérias brasileiras

Processo: 22/02872-4
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Projeto Inicial
Data de Início da vigência: 01 de abril de 2023
Data de Término da vigência: 31 de março de 2028
Área do conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Química - Química Orgânica
Pesquisador responsável:Camila Manoel Crnkovic
Beneficiário:Camila Manoel Crnkovic
Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas (FCF). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Pesquisadores associados: Alessandra S Eustaquio ; Frederico José Gueiros Filho ; Leticia Veras Costa Lotufo ; Roger Linington
Bolsa(s) vinculada(s):25/02439-7 - Sequenciamento e mineração de genomas de cianobactérias brasileiras visando identificar clusters de genes biossintéticos, BP.IC
25/03645-0 - Metabolômica para a desreplicação de produtos naturais de cianobactérias, BP.MS
24/00339-2 - Comunicar Ciência: da Biodiversidade à Biotecnologia de Produtos Naturais, BP.JC
+ mais bolsas vinculadas 24/00342-3 - Comunicar Ciência: da Biodiversidade à Biotecnologia de Produtos Naturais, BP.JC
24/04602-0 - Construção de uma biblioteca química de extratos pré-fracionados de cianobactérias, BP.TT
24/02692-1 - Desreplicação em microescala para acelerar a descoberta de produtos naturais de cianobactérias, BP.DD
23/05381-4 - Construção de uma biblioteca química de extratos pré-fracionados de cianobactérias, BP.TT
23/03532-5 - Explorando eliciadores químicos para a prospecção de produtos naturais de cianobactérias, BP.IC - menos bolsas vinculadas
Assunto(s):Química de produtos naturais  Cianobactérias  Descoberta de drogas  Genômica  Metabolômica 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Cyanobacteria | Dereplication | drug discovery | Genomics | Metabolomics | Secondary Metabolites | Química de Produtos Naturais

Resumo

Produtos naturais continuam a fornecer esqueletos químicos importantes para o desenvolvimento de fármacos. A prospecção de organismos pouco estudados utilizando abordagens ortogonais são estratégias que podem ser integradas para aprimorar a descoberta de produtos naturais. Cianobactérias são procariontes fotossintetizantes que produzem metabólitos secundarários com atividade biológica. Contudo, a química das cianobactérias ainda é pouco investigada. Nosso grupo de pesquisa implementou um fluxo de trabalho para a criação de uma biblioteca de extratos pré-fracionados de cianobactérias. Ensaios biológicos e metabolômica têm sido utilizados na análise e priorização de amostras para investigações subsequentes. Nesse projeto, propõe-se expandir esse "pipeline" para a incluir a sistematização do processo de desreplicação e atingir o objetivo de isolar e elucidar a estrutura de novos produtos naturais de cianobactérias brasileiras. As abordagens de prospecção também serão diversificadas com o intuito de aumentar as chances de descoberta. Extratos pré-fracionados serão submetidos a um fracionamento secundário por HPLC, seguido de desreplicação em microescala usando espectrometria de massas e espectroscopia de ressonância magnética nuclear. Uma estratégia adicional de desreplicação combinará marcação por isótopo estável e metabolômica. Serão aplicadas estratégias complementares de prospecção baseadas em mineração genômica e triagem de eliciadores químicos. Moléculas novas e bioativas serão priorizadas para isolamento e elucidação estrutural. Esse projeto visa estabelecer uma linha de pesquisa em descoberta de produtos naturais microbianos na Faculdade de Ciências Farmacêuticas (USP). Ele criará oportunidades de pesquisa para alunos de graduação, mestrado e doutorado. Propõe-se também atualizar a ementa de uma disciplina de pós-graduação e de uma disciplina de graduação, além do desenvolvimento de um livro didático colaborativo abordando tópicos relacionados ao presente projeto. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
WEISS, MARCIO B.; BORGES, RICARDO M.; SULLIVAN, PETER; DOMINGUES, JOAO P. B.; DA SILVA, FRANCISCO H. S.; TRINDADE, VICTORIA G. S.; LUO, SHANGWEN; ORJALA, JIMMY; CRNKOVIC, CAMILA M.. Chemical diversity of cyanobacterial natural products. NATURAL PRODUCT REPORTS, v. N/A, p. 44-pg., . (22/02872-4, 19/17721-9, 21/14754-3, 20/07710-7)
CAMPOS, THAISSA GIOVANNA VALVERDE; GAMA, WATSON A.; GERALDES, VANESSA; YOON, JAEWON; CRNKOVIC, CAMILA M.; PINTO, ERNANI; JACINAVICIUS, FERNANDA RIOS. New records on toxic cyanobacteria from Brazil: Exploring their occurrence and geography. Science of The Total Environment, v. 931, p. 14-pg., . (22/02872-4, 24/02448-3, 21/10573-4, 20/07710-7, 19/27707-3, 23/00525-8, 13/07914-8, 21/00149-0)
ALMEIDA, ERYKA COSTA; JACINAVICIUS, FERNANDA RIOS; PASSOS, LARISSA SOUZA; MEDICE, RHUANA VALDETARIO; MARQUES, LUCAS GREGORIO; CRNKOVIC, CAMILA MANOEL; MARINHO, MARCELO MANZI; GOMES, LEVY DE CARVALHO; PINTO, ERNANI. Phytoplankton composition and metabolomic profiles in aquaculture systems: A case study in Brazil's natural lakes. Aquaculture, v. 599, p. 13-pg., . (22/02872-4, 21/14239-1, 24/02448-3, 13/07914-8, 21/00149-0)