Montagem e anotação de genomas de Calliphoridae

Resumo

A existência de espécies proximamente relacionadas e com hábitos alimentares contrastantes na família Calliphoridae a torna um grupo ideal para o estudo da evolução de especializações tróficas. Métodos de genômica comparativa permitirão o estudo da relação entre diversidade genômica e variação fenotípica. No projeto temático ao qual este se associa, "Dimensions US-BIOTA-São Paulo: More to the blow fly than meets the eye - understanding evolutionary and genetic origins of diverse trophic specializations", iremos comparar os genomas de pelo menos 14 espécies de Calliphoridae com diferentes hábitos alimentares. Destas espécies, iremos sequenciar e anotar pela primeira vez os genomas de oito espécies. O técnico será responsável pela montagem e anotação desses genomas, bem como pela preparação e submissão dos dados a bancos de dados públicos. Como parte do projeto colaborativo, também investigaremos o hábito facultativo de Lucilia cuprina por meio de experimentos de seleção artificial seguidos de sequenciamento. O técnico também auxiliará na criação de linhagens de L. cuprina que se desenvolverão (e evoluirão), ao longo de várias gerações (20-30), em substrato em decomposição ou fresco, e sequenciará o genoma completo das linhagens de L. cuprina em três momentos distintos. (AU)