Exosítios de proteínas,sítios crípticos e moonlighting: identificação, mapeamento funcional e efeitos de alteração estrutural

Resumo

O projeto envolve o desenvolvimento de uma abordagem multicamadas para identificar exosites de proteínas usando compilação de dados e treinamento de rede neural. Um pipeline será desenvolvido para identificar potenciaisparceiros de proteínas usando experimentos de exibição de fagos e informações de co-localização. O uso de MRND ajudará a identificar parceiros proteína-proteína que interagem em loci de exosite. O projeto também envolverátriagem virtual de compostos nos exosites identificados de proteínas-alvo para identificar potenciais candidatos amedicamentos, levando em consideração a flexibilidade dos bolsos usando uma abordagem de conjunto. As bibliotecas internas de D-oligopeptídeos também serão rastreadas contra os bolsões identificados usando umaabordagem semelhante. Além dos objetivos acima, este projeto também explorará o uso de NMR e metabolômica para investigar melhor os exosítios e identificar potenciais candidatos a medicamentos. Essas técnicas complementarão os outros métodos do projeto e fornecerão uma compreensão mais abrangente dos modelos.