A modalidade Apoio à Propriedade Intelectual (PAPI/NUPLITEC) tem o objetivo de orientar e auxiliar os pesquisadores na defesa da propriedade intelectual dos inventos resultantes de pesquisas financiadas pela Fundação. Os projetos são desenvolvidos sob a responsabilidade de um Pesquisador Principal, vinculado a instituições superiores de ensino e pesquisa no Estado de São Paulo. A seleção é feita por meio de análise pelos pares.
A Portaria PR N.65, de 08 de junho de 2021, define novas atribuições ao Núcleo de Patenteamento e Licenciamento de Tecnologia da FAPESP (NUPLITEC) e encerra o Programa de Apoio à Propriedade Intelectual (PAPI).