Conjunto de Auxílios à Pesquisa e Bolsas orientados a objetivos.
Programas Estratégicos
Os Programas voltados a Temas Específicos têm o objetivo de induzir o desenvolvimento de pesquisas que promovam o avanço da fronteira do conhecimento, suas aplicações em áreas respectivamente relacionadas e subsídios à formulação de políticas públicas.
Pesquisa em Biodiversidade (BIOTA)
Centros de Ciência para o Desenvolvimento (CCD)
Pesquisa em Políticas Públicas
Programa QuTIa em Tecnologias Quânticas
Pesquisa em Bioenergia (BIOEN)
Programas para apoio à Pesquisa em e com Empresas
Os Programas para apoio à pesquisa em e com empresas têm caráter indutor: apoiam pesquisas com potencial de desenvolvimento de novas tecnologias e de aplicação prática nas diversas áreas do conhecimento, afinadas com a política de Ciência, Tecnologia e Inovação.
Consórcios Setoriais para Inovação Tecnológica (CONSITEC)
Pesquisa Inovativa em Pequenas Empresas (PIPE)
Programas para apoio à Colaboração em Pesquisa entre Universidades / Institutos e empresas
Pesquisa em Parceria para Inovação Tecnológica (PITE)
Centros de Pesquisa em Engenharia/Centros de Pesquisa Aplicada (CPE/CPA)
Centros Internacionais de Pesquisa (CIP)
Programas voltados a Políticas Públicas
Os Programas de Pesquisa voltados a Políticas Públicas têm caráter indutor: apoiam pesquisas com potencial de desenvolvimento de novas tecnologias e de aplicação prática nas diversas áreas do conhecimento, afinadas com a política de Ciência, Tecnologia e Inovação do governo estadual.
Programa de Pesquisa para o SUS (PP-SUS)
Centros de Pesquisa, Inovação e Difusão (CEPID)
Programas de Infraestrutura de Pesquisa
O objetivo é recuperar e modernizar instalações de pesquisa e coleções das instituições de ensino superior e de pesquisa no Estado de São Paulo, por meio dos subprogramas que compõem essa linha de apoio da FAPESP. Iniciados em 1995, os programas contribuem com resultados positivos para o sistema de ciência e tecnologia paulista.
Apoio à Infraestrutura de Pesquisa
Programa Equipamentos Multiusuários (EMU)
Programa Jovens Pesquisadores em Centros Emergentes
Museus, Centros Depositários de Informações e Documentos e de Coleções Biológicas
Scientific Electronic Library Online (SciELO)
Programa Modernização de Institutos Estaduais de Pesquisa
Programas encerrados
Apoio à Propriedade Intelectual (PAPI/NUPLITEC)
Cooperação Interinstitucional de Apoio à Pesquisa sobre o Cérebro (CInAPCe)
Pesquisa em Centros de Ciências do Estado de São Paulo
Rede de Biologia Estrutural em Tópicos Avançados de Ciências da Vida (Smolbnet)
Rede de Diversidade Genética de Vírus (VGDN)
Sistema Integrado de Hidrometeorologia do Estado de São Paulo (SIHESP)
Sistema Paulista de Parques Tecnológicos
Tecnologia da Informação no Desenvolvimento da Internet Avançada (TIDIA)