Análise dupla de RNA-seq de Trichophyton rubrum e co-cultura de queratinócitos HaCat destacam importantes genes para interação fungo-hospedeiro

• Processo: 18/14179-6
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Publicações científicas - Artigo
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2018
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2019
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Ana Lucia Fachin Saltoratto
• Beneficiário: Ana Lucia Fachin Saltoratto
• Instituição Sede: Universidade de Ribeirão Preto (UNAERP). Campus Ribeirão Preto. Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Município da Instituição Sede: Ribeirão Preto
• Vinculado ao auxílio: 16/22701-9 - "Estudo da resposta a antifúngicos e da interação fungo-hospedeiro do dermatofito Trichophyton rubrum utilizando diferentes modelos de infecção", AP.R
• Assunto(s): Infecção Expressão gênica Análise de sequência de RNA Macrófagos Arthrodermataceae Dermatófitos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: barreira epitelial | ciclo do glioxilato | Dermatófitos | infeccao | Macrófagos | RNA seq | expressão gênica

Resumo

O dermatófito Trichophyton rubrum é o maior causador de infecções fúngicas de pele, cabelos e unhas, utilizando substratos queratinizados como seus principais nutrientes durante o processo infeccioso. Apesar de restritas às camadas superficiais da epiderme, estas infecções podem apresentar caráter invasivo e de maior gravidade em pacientes imunocomprometidos e diabéticos. Apesar da grande importância clínica das dermatofitoses causadas por T. rubrum, há uma maior compreensão da relação fungo-hospedeiro em alguns fungos de interesse clinico, como Candida e Aspergillus. Além disso, estratégias que possibilitem melhor compreensão dos mecanismos moleculares que envolvem a interação entre T. rubrum- hospedeiro ainda são escassos devido às limitações encontradas nos modelos que mimetizem esta interação. O sequenciamento por Dual RNA-seq é uma poderosa ferramenta para desvendar esta complexa interação, pois permite avaliar simultaneamente o transcriptoma de dois organismos, numa situação de infecção. Fazendo uso desta promissora tecnologia aliado à um modelo de co-cultivo in vitro entre linhagem de queratinócitos humanos HaCat e T. rubrum, o presente trabalho avaliou o perfil transcricional de genes envolvidos na interação fungo- hospedeiro por 24 horas. Nossos dados mostraram que neste período T. rubrum induziu genes específicos do ciclo do glioxilato, o gene ERG6 e o TERG_00916 que codifica um transportador de ácido carboxílico que em conjunto podem contribuir para melhor assimilação de nutrientes e sobrevivência do fungo ao hospedeiro. Ademais foram modulados genes que codificam proteases queratinolíticas importantes para a virulência de T. rubrum durante o processo infeccioso. Já as células de queratinócitos HaCat induziram os genes SLC11A1, RNASE7 e CSF2 cujos produtos gênicos são conhecidos por apresentarem atividade antimicrobiana, genes envolvidos no reparo da barreira epitelial e favorecimento da migração celular e inibiram os genes FLG e KRT1 envolvidos com a integridade da barreira epitelial. Esta análise de transcriptoma misto mostrou a modulação de genes importantes envolvidos no mecanismo de infecção de T.rubrum e defesa e manutenção da homeostasia celular em células de queratinocitos, evidenciando potenciais alvos antifúngicos para novas abordagens terapêuticas no tratamento das dermatofitoses. (AU)