Compendio abrangente de fatores de transcrição bovinos curado manualmente

• Processo: 18/18262-5
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Publicações científicas - Artigo
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2018
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2019
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: Luciana Correia de Almeida Regitano
• Beneficiário: Luciana Correia de Almeida Regitano
• Instituição Sede: Embrapa Pecuária Sudeste. Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA). Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento (Brasil). São Carlos , SP, Brasil
• Assunto(s): Biologia computacional Banco de dados Expressão gênica Bovinos Fatores de transcrição
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Banco de dados | bovino | Cofator de transcrição | DNA-binding domain | expressão gênica | Fator de transcrição | Bioinformática

Resumo

Fatores de transcrição (FTs) são proteínas reguladoras que controlam a expressão gênica de forma dependente do contexto e específica ao tecido. Em contraste com humanos, para o qual existem abrangentes coleções de FTs, os FTs bovinos foram apenas compilados de forma rudimentar. Nesse artigo, apresentamos um compêndio curado manualmente de 865 FTs bovinos ligantes de DNA de maneira específica a sequencia, para os quais nós analisamos a distribuição das famílias de domínios, conservação evolutiva e expressão tecido-específica. Além disso, fornecemos uma lista de prováveis cofatores de transcrição derivados de interações já conhecidas com os FTs identificados. Como existe escassez generalizada de conhecimento sobre a regulação da expressão gênica em bovinos, a lista curada de FTs deve prover uma base para melhor compreensão dos mecanismos regulatórios específicos da espécie. (AU)