Expansão da infraestrutura computacional para análises em genômica e transcriptômica

• Processo: 20/13532-4
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Reserva Técnica para Infraestrutura Institucional de Pesquisa
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2021
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2022
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Luiz Fernando Lima Reis
• Beneficiário: Luiz Fernando Lima Reis
• Instituição Sede: Hospital Sírio-Libanês. Sociedade Beneficente de Senhoras (SBSHSL). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Biologia computacional Biologia molecular Oncologia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Biologia molecular | Oncologia | Bioinformática

Resumo

O Hospital Sírio Libanês (HSL) entende que a atividade de pesquisa é vital para a excelência, pioneirismo, qualidade e inovação de qualquer instituição. Há mais de uma década, o HSL vem investindo de maneira consistente em pesquisa básica e translacional em diversas áreas do conhecimento. De maneira geral, entre as principais áreas de investimento do HSL destacam-se aquelas ligadas à Oncologia, Biologia Molecular, Genômica e Bioinformática. O denominador comum entre todas essas áreas é a necessidade de computação de alto-desempenho para análises dos dados gerados e obtenção de resultados significativos. Por exemplo, uma parte majoritária dos projetos em genômica e oncologia molecular envolvem processamento de dados de sequenciamento de DNA e isso é feito por algoritmos computacionais complexos que requerem uma estrutura computacional robusta. Ciente de que os recursos da Reserva Técnica Institucional (RTI) concedidos pela FAPESP visa apoiar o estabelecimento de uma infraestrutura de pesquisa que beneficie pesquisadores e projetos de Pesquisa apoiados pela FAPESP, solicitamos o uso desta RTI para melhorar a estrutura computacional de servidores do nosso instituto de pesquisa. De maneira específica, pretendemos adquirir um ótimo computador (servidor) para realizar análises em larga escala de dados gerados nas áreas supracitadas. Entre as análises, aquelas ligadas ao processamento de dados de sequenciamento de genomas e transcriptomas (em plataformas de nova geração) se destacam. Vale ressaltar que praticamente todos os projetos-FAPESP vigentes da nossa instituição necessitam de análises computacionais e poderão se beneficiar dessa estrutura. Também vale destacar que possuímos uma estrutura técnica para hospedar (em um Datacenter de última geração) e um corpo especializado de técnicos para operar e manter essa máquina. Por todas essas razões, acreditamos que a aprovação do uso desta RTI irá beneficiar pesquisadores e projetos do nosso centro de pesquisa e alavancar a qualidade das análises computacionais que realizamos em nossa instituição. (AU)