Uso sustentável da biodiversidade brasileira: aplicação de dados vinculados para a descoberta de produtos naturais

• Processo: 20/11967-3
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2021
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2025
• Área do conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Química - Química Orgânica
• Acordo de Cooperação: DFG
• Pesquisador responsável: Vanderlan da Silva Bolzani
• Beneficiário: Vanderlan da Silva Bolzani
• Pesquisador Responsável no exterior: Thomas Riechert
• Instituição Parceira no exterior: Leipzig University of Applied Sciences, Alemanha
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Araraquara. Araraquara , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Adriano Defini Andricopulo ; Alan Cesar Pilon ; Edgard Luiz Marx ; João Victor da Silva e Silva ; Marilia Valli
• Auxílio(s) vinculado(s): 22/08333-8 - Acelerando a descoberta de produtos naturais, AP.R
• Bolsa(s) vinculada(s): 24/13504-1 - Integração da Base de Dados de Produtos Naturais da Biodiversidade brasileira com bases de dados químico-biológicas, BP.TT; 24/13507-0 - Integração de dados e website da Base de Dados de Produtos Naturais da Biodiversidade brasileira, BP.TT
• Assunto(s): Bases de dados Gestão do conhecimento Linked data Produtos naturais Biodiversidade Sustentabilidade
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: biodiversidade brasileira | Produtos Naturais | Produtos naturais/Computação

Resumo

Este projeto envolve a atualização da semântica web da Base de Dados NuBBE para alcançar interoperabilidade entre outras bases e análise de metadados de produtos naturais. A biodiversidade de ambientes tropicais oferece um potencial particularmente valioso na diversidade química de produtos naturais, a fonte mais tradicional para o desenvolvimento de novos fármacos. A Base de Dados NuBBE (NuBBEDB) é a primeira biblioteca de produtos naturais da biodiversidade brasileira, e tem sido reconhecida como uma importante fonte de informações para diversas áreas de estudos. Atualmente, esta base de dados contém mais de 2.200 compostos, acessíveis gratuitamente online e fornece dados valiosos como informações químicas, espectrais, biológicas, taxonômicas, geográficas e farmacológicas. Esse banco de dados é uma ferramenta de pesquisa útil não só para fins científicos, mas também pode auxiliar na tomada de decisões, apoiar políticas públicas, investimentos privados e também incentivar a preservação e o uso sustentável da biodiversidade brasileira. Neste projeto, pretendemos pesquisar os aspectos relacionados à criação e gestão de conhecimento químico para facilitar o acesso e compartilhamento de informações, bem como seu uso em aprendizagem de máquina aplicada. Para atingir este objetivo, propomos aumentar a organização do banco de dados NuBBEDB usando taxonomias e ontologias e integrá-lo com outros bancos de dados para cruzar informações. O uso dessas informações enriquecidas será importante para o planejamento de fármacos inspirados em produtos naturais, bem como para aumentar a consciência da comunidade sobre os valores dos recursos naturais e seu uso sustentável. (AU)

Publicações científicas

(7)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

CALEMI, DEBORA BRESSANIM DE AQUINO; GODOI, ALEXANDRE BARCIA; MINUTI, GIULIA; NETO, FAUSTO CARNEVALE; HISPAGNOL, GABRIEL FELIPE; PILON, ALAN CESAR; COSTA, JOSE LUIZ; HYSLOP, STEPHEN; ANTUNES, NATALICIA DE JESUS. Evaluation of Violacein Metabolic Stability and Metabolite Identification in Human, Mouse, and Rat Liver Microsomes. PHARMACEUTICS, v. 17, n. 5, p. 28-pg., 2025-05-02. (20/02207-5, 20/11967-3, 14/50867-3, 23/07323-1)

DA SILVA, WALACE BRENO; HISPAGNOL, GABRIEL FELIPE; NUNES, EMANUEL VICTOR DOS SANTOS; CASTRO-GAMBOA, IAN; PILON, ALAN CESAR. Plant Sample Preparation for Metabolomics, Lipidomics, Ionomics, Fluxomics, and Peptidomics. SEPARATIONS, v. 12, n. 2, p. 21-pg., 2025-02-01. (19/15889-0, 20/02207-5, 14/50926-0, 20/11967-3)

VALLI, MARILIA; DOERING, THIAGO H.; MARX, EDGARD; FERREIRA, LEONARDO L. G.; MEDINA-FRANCO, JOSE L.; ANDRICOPULO, ADRIANO D.. Neglected Tropical Diseases: A Chemoinformatics Approach for the Use of Biodiversity in Anti-Trypanosomatid Drug Discovery. BIOMOLECULES, v. 14, n. 8, p. 19-pg., 2024-08-01. (20/11967-3, 14/50926-0, 19/05967-3, 22/08333-8, 13/07600-3)

GOMEZ-GARCIA, ALEJANDRO; JIMENEZ, DANIEL A. ACUNA; ZAMORA, WILLIAM J.; BARAZORDA-CCAHUANA, HARUNA L.; CHAVEZ-FUMAGALLI, MIGUEL A.; VALLI, MARILIA; ANDRICOPULO, ADRIANO D.; BOLZANI, VANDERLAN DA S.; OLMEDO, DIONISIO A.; SOLIS, PABLO N.; et al. Navigating the Chemical Space and Chemical Multiverse of a Unified Latin American Natural Product Database: LANaPDB. PHARMACEUTICALS, v. 16, n. 10, p. 21-pg., 2023-10-01. (20/11967-3, 14/50926-0, 19/05967-3, 22/08333-8, 13/07600-3)

ALVES, NATALIA FELIX; RIBEIRO, DAYANE CASTRO; MANNOCHIO-RUSSO, HELENA; QUEIROZ, SUZANA APARECIDA SILVA; ZOCOLO, GUILHERME JULIAO; BOLZANI, VANDERLAN DA SILVA; VALLI, MARILIA. Advanced Glycation End Products Inhibitors from Talisia esculenta. REVISTA VIRTUAL DE QUIMICA, v. N/A, p. 7-pg., 2023-04-24. (20/11967-3, 13/07600-3, 14/50926-0, 19/05967-3)

GOMEZ-GARCIA, ALEJANDRO; JIMENEZ, DANIEL A. ACUNA; ZAMORA, WILLIAM J.; BARAZORDA-CCAHUANA, HARUNA L.; CHAVEZ-FUMAGALLI, MIGUEL A.; VALLI, MARILIA; ANDRICOPULO, ADRIANO D.; BOLZANI, VANDERLAN DA S.; OLMEDO, DIONISIO A.; SOLIS, PABLO N.; et al. Latin American Natural Product Database (LANaPDB): An Update. JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING, v. 64, n. 22, p. 15-pg., 2024-11-06. (20/11967-3, 14/50926-0, 22/08333-8, 13/07600-3)

ESPINOZA-CHAVEZ, ROCIO MARISOL; REZENDE JUNIOR, CELSO DE OLIVEIRA; DE SOUZA, MARIANA LAUREANO; CHELUCCI, RAFAEL CONSOLIN; MICHELAN-DUARTE, SIMONE; KROGH, RENATA; FERREIRA, LEONARDO LUIZ GOMES; VALLI, MARILIA; DE OLIVEIRA, ALDO SENA; ANDRICOPULO, ADRIANO D.; et al. Structure-Metabolism Relationships of Benzimidazole Derivatives with anti-Trypanosoma cruzi Activity for Chagas Disease. CHEMMEDCHEM, v. 19, n. 20, p. 21-pg., 2024-08-27. (18/14268-9, 13/25658-9, 20/11967-3, 14/50926-0, 19/05967-3, 15/50655-9, 22/08333-8, 13/07600-3, 15/09080-2)