São Paulo Workshop on Spatial OMICs

• Processo: 22/15436-8
• Modalidade de apoio: Auxílio Organização - Reunião Científica
• Data de Início da vigência: 16 de outubro de 2023
• Data de Término da vigência: 17 de outubro de 2023
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Morfologia - Citologia e Biologia Celular
• Pesquisador responsável: Marilene Hohmuth Lopes
• Beneficiário: Marilene Hohmuth Lopes
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Município da Instituição Sede: São Paulo
• Assunto(s): Neoplasias Ciência de dados Expressão gênica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: câncer | Data Science | expressão gênica | Transcriptômica Espacial | Expressão Gênica

Resumo

First Day - 22nd May 2023 Introduction to Spatial TranscriptomicsSpeaker: Dr. Luciane KagoharaIs Spatial Transcriptomics the right approach for you? Speaker: Dr. Elana Judith FertigProtocol dry-runSpeakers: Dr. Luciane Kagohara; Dr. Marilene Lopes; Dr. Bárbara CoelhoBioinformatics practice: Basic analysis, clustering, expression. Speaker/Instructors: Dr. Dimitri Sidiropoulos; Dr. Elana FertigSecond Day -23rd May 2023Bioinformatics practice: How to identify expression profiles with biological relevance - Part 1 Instructors: Dr. Dimitri Sidiropoulos; Dr. Elana FertigBioinformatics practice: How to identify expression profiles with biological relevance - Part 2Instructors: Dr. Dimitri Sidiropoulos; Dr. Elana FertigBioinformatics practice: Analyzing cell-cell interactions Integrated analysis of spatial with single-cell transcriptomics Speaker/Instructor: Dr. Dr. Elana Judith FertigPrediction of cell communication from spatial omics data Speaker/Instructor: Dr. Edroaldo LummertzInference of spatially resolved cell communication using SpotComm -Speaker/Instructor: Dr. Marcelo FalchettiUnderstanding informational hierarchy from spatial omics datasets - paving the way for interpretable AI.Speaker/Instructor: Dr Shamini Ayyadhury (AU)