Desenvolvimento e aplicações de métodos computacionais a simulação de materia macia

• Processo: 23/03748-8
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Pesquisador Visitante - Internacional
• Data de Início da vigência: 07 de outubro de 2023
• Data de Término da vigência: 06 de novembro de 2023
• Área do conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Física - Física da Matéria Condensada
• Pesquisador responsável: Thereza Amélia Soares da Silva
• Beneficiário: Thereza Amélia Soares da Silva
• Pesquisador visitante: Willem Frederik Van Gunsteren
• Instituição do Pesquisador Visitante: Swiss Federal Institute of Technology Zurich, Suíça
• Instituição Sede: Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 13/08293-7 - CECC - Centro de Engenharia e Ciências Computacionais, AP.CEPID
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Campo de Força GROMOS | Interação Teoria-Experimento em Sistemas Biológicos | Métodos Avançados de Simulação Molecular | Métodos para Cálculo de Energia Livre | Software GROMOS | Biofísica Computacional

Resumo

A área de simulações moleculares atingiu a maturidade. Simulações moleculares capturam uma ampla variedade de processos (bio)moleculares importantes, incluindo mudanças conformacionais, ligação de moléculas a um receptor e enovelamento de proteínas, descrevendo as posições de átomos constituintes desses sistemas em resolução temporal de femtossegundos. As simulações de dinâmica molecular (MD) são frequentemente usadas em combinação com uma ampla variedade de técnicas experimentais de biologia estrutural, incluindo cristalografia de raios-x, criomoscoscopia eletrônica de transmissão (crio-EM), ressonância magnética nuclear (NMR), ressonância paramagnética eletrônica (EPR), e transferência de energia de ressonância Förster (FRET), entre outros. O Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM) - incluindo o Laboratório Nacional de Luz Síncrotron (LNLS) - oferece uma oportunidade única de reunir cientistas experimentais e físicos/químicos computacionais brasileiros para enfrentar grandes desafios científicos nas áreas de biofísica e materiais. Esta proposta busca financiamento para uma cátedra professor visitante receber o Prof. Wilfred van Gunsteren (ETHZ, Suíça) durante sua visita ao Estado de São Paulo. A proposta é apoiada por 8 pesquisadores de diferentes instituições públicas em São Paulo (LNNano, UNICAMP, UNESP e USP), 05 PPGs e pela Sociedade Brasileira de Biofísica. Além disso, a visita estará associada ao Center for Computing in Engineering and Sciences (CCES) (CEPID 2013/08293-7) (AU)