EMU Infraestrutura de Acervos e Coleções: aquisição de sistema de robótica para manutenção e análise em larga escala e alto desempenho de linhagens geneticamente modificadas de Saccharomyces cerevisiae e de outros microrganismos

• Processo: 22/11384-3
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa Infraestrutura - Acervos e Coleções
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2023
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2026
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Biologia e Fisiologia dos Microorganismos
• Pesquisador responsável: Luis Eduardo Soares Netto
• Beneficiário: Luis Eduardo Soares Netto
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Ariel Mariano Silber ; José Renato Rosa Cussiol ; Luciana Elena de Souza Fraga Machado
• Bolsa(s) vinculada(s): 24/08637-2 - Suporte técnico de sistema de robótica para manutenção e análise em larga escala e alto desempenho de linhagens geneticamente modificadas de Saccharomyces cerevisiae., BP.TT
• Assunto(s): Robótica Genética Leveduras Saccharomyces cerevisiae Sequenciamento de alta performance Aquisição de equipamentos Infraestrutura de pesquisa
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: automação em genética | levedura | Saccharomyces cerevisiae | triagem de alto desempenho | biologia de levedura

Resumo

A levedura Saccharomyces cerevisiae é o organismo-modelo mais simples e o mais amplamente investigado entre os eucariontes. Esse microorganismo pode ser cultivado em placas de ágar ou meio líquido; cresce rapidamente e é facilmente manipulado genética e bioquimicamente. Além disso, aplicação de várias técnicas de biologia molecular, bioquímica e genética estão muito bem estabelecidas nesse organismo-modelo. Além disso, um repositório (SGD = Saccharomyces Genome Database) está publicamente disponível na internet (https://www.yeastgenome.org/) com acesso gratuito e informações abrangentes e integradas, o que tem estimulado a descoberta de funções associadas a genes, muitos dos quais estão conservados em humanos. De fato, várias contribuições relevantes foram produzidas por estudos com leveduras, por exemplo, relacionadas à regulação do ciclo celular; autofagia; transcrição; respostas a estresses distintos; mecanismos subjacentes a neurodegeneração, entre outros processos. Algumas dessas contribuições foram agraciadas com prêmios Nobel (https://www.yeastgenome.org/blog/a-nobel-prize-for-work-in-yeast-again). Várias coleções de leveduras geneticamente modificadas são mantidas e disponibilizadas gratuitamente pelo laboratório de Proteínas e Biologia Redox coordenado pelo Dr. Luis Netto (IB-USP). Outras coleções e linhagens são mantidas por grupos associados a essa proposta. Seria importante melhorar a infraestrutura desse recurso compartilhado por vários grupos de pesquisa brasileiros com a aquisição do sistema robótico ROTOR+ e PIXL (https://www.singerinstruments.com/solution/rotorpixl). ROTOR+ e PIXL formam um conjunto de equipamentos que operam com propósitos complementares. As colônias selecionadas por PIXL podem dar origem a bibliotecas que são ordenadas, replicadas, ou acasaladas a outras linhagens em ROTOR+. Assim, além de ser importante para realização de réplicas das coleções que dispomos atualmente nos laboratórios, esse sistema de robótica possibilitará a realização de experimentos em escala genômica como ensaios de SGA (Synthetic Genetic Array) e BiFC (Bimolecular Fluorescence Complementation). A realização de triagens de alto desempenho, devem possibilitar determinações de correlações genótipo-fenótipo em escala genômica, através de abordagens de biologia de sistemas. Outro resultado que pode ser gerado por esse projeto é o aumento da interação entre grupos de pesquisa que irão compartilhar o uso do ROTOR+ e PIXL. Coleções de outros microrganismos geneticamente modificados poderão também ser mantidas e investigadas pelo uso desse sistema de robótica. (AU)