Análises Quantitativas e Genômicas de Características Relacionadas a Tolerância à Baixas Temperaturas em uma População Sintética de Tambaqui (Colossoma macropomum)

• Processo: 22/08831-8
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2024
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2026
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Recursos Pesqueiros e Engenharia de Pesca - Aquicultura
• Pesquisador responsável: Rafael Vilhena Reis Neto
• Beneficiário: Rafael Vilhena Reis Neto
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Agrárias. Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus do Vale do Ribeira. Registro , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Alexandre Wagner Silva Hilsdorf ; Antônio Fernando Gervásio Leonardo ; Camila Fernandes Corrêa ; Diogo Teruo Hashimoto ; Eduardo Antônio Sanches ; Jose Manuel Yanez ; Luciana Shiotsuki ; Vander Bruno dos Santos
• Assunto(s): Estudo de associação genômica ampla Herdabilidade Seleção genética Seleção genômica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Gwas | herdabilidade | seleção genetica | selecao genomica | genética e melhoramento

Resumo

Utilizando abordagens quantitativas e moleculares, propõe-se verificar a possibilidade de se obter ganho genético por seleção para características relacionadas a tolerância à baixas temperaturas em uma população de tambaqui composta por 40 famílias de irmãos-completos. Cerca de 30 animais de cada família, identificados com microchips, serão testados, durante 90 dias, em 2 baterias de 10 caixas de polietileno com capacidade de 500L. Uma das baterias irá operar em sistema de recirculação com controle de temperatura (28°C), já a segunda bateria terá fluxo contínuo de água. Durante o período de teste, as caixas serão monitoradas para o registro dos animais mortos, e após os 90 dias os animais sobreviventes serão pesados e medidos. A genotipagem dos parentais e de 20% da progênie será realizada utilizando um painel de SNP's de alta densidade (30k), enquanto o restante dos animais será genotipado usando um painel de baixa-densidade (0,5 - 3 k). Os genótipos parentais serão usados como referência para a imputação de genótipos das progênies genotipadas em baixa densidade. Considerando apenas as informações fenotípicas e de parentesco dos indivíduos fornecido pelo pedigree (PBLUP), serão estimados os valores genéticos dos animais e verificada a existência da interação Genótipo x Ambiente para as características avaliadas nas baterias de caixas com e sem controle de temperatura por meio dos parâmetros genéticos. As análises de associação genômica ampla serão realizadas para características medidas, em cada ambiente separadamente, usando as abordagens ssGBLUP e wssGBLUP implementadas no software estatístico BLUPF90. Também serão comparadas as predições dos valores genéticos dos animais baseada em pedigree (PBLUP) versus predição genômica (GBLUP). (AU)