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O perfil taxonômico e transcricional do holobionte esclarecendo o papel e a dinâmica das populações endofíticas durante o desenvolvimento da planta

Processo: 23/18239-1
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Regular
Data de Início da vigência: 01 de maio de 2024
Data de Término da vigência: 30 de abril de 2026
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
Pesquisador responsável:Fabiana Fantinatti Garboggini
Beneficiário:Fabiana Fantinatti Garboggini
Instituição Sede: Centro Pluridisciplinar de Pesquisas Químicas, Biológicas e Agrícolas (CPQBA). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Paulínia , SP, Brasil
Pesquisadores associados: Lilia Costa Carvalhais ; Marcos Nopper Alves ; Pedro Henrique Riboldi Monteiro
Bolsa(s) vinculada(s):24/22068-0 - Micropropagação vegetativa de Passiflora incarnata para avalição da comunidade microbiana sintética capaz de influenciar positivamente o crescimento da planta., BP.TT
Assunto(s):Metatranscriptômica  Metagenômica  Interação planta-animal  Consórcios microbianos  Micro-organismos endofíticos  Desenvolvimento vegetal 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:consórcio microbiano | Interação planta-microrganismo | metagenômica | metatranscriptômica | Bioinsumos

Resumo

A montagem do microbioma endofítico pode ser explicada por processos ecológicos que ocorrem durante o desenvolvimento da planta, como dispersão, deriva, seleção e diversificação. A fisiologia da planta é influenciada por fatores bióticos e abióticos e pode, portanto, variar substancialmente ao longo do seu ciclo de vida. Por sua vez, essas variações modificam consequentemente a estrutura e as funções das comunidades endofíticas, uma vez que grupos endofíticos específicos com papel crítico em um determinado estágio de desenvolvimento podem ser favorecidos. Considerando o exposto, este estudo tem como objetivo testar a hipótese de que a montagem e o funcionamento do microbioma endofítico podem ser moldados por variações transcricionais que ocorrem durante o desenvolvimento da planta. Para isso, avaliaremos o perfil funcional de P. incarnata e suas populações endofíticas associadas por meio de RNA-seq multiespécies. Além disso, o microbioma endofítico será caracterizado por uma abordagem metagenômica para determinação de sua estrutura e composição em cada estágio de desenvolvimento do hospedeiro. Esta investigação incluirá também o desenho e introdução de uma comunidade bacteriana sintética capaz de influenciar positivamente o crescimento de P. incarnata. A introdução de uma comunidade simplificada em um sistema vegetal gnotobiótico permitirá desembaraçar os processos que governam a montagem do microbioma endofítico nos estágios iniciais do desenvolvimento do hospedeiro. A compreensão mecanicista da montagem do microbioma vegetal permitiria a incorporação de processos ecoevolutivos no desenvolvimento de aplicações biotecnológicas para sistemas agrícolas. (AU)

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