EMU: Equipamento multiusuário para Centro de Genômica Funcional da ESALQ

• Processo: 23/17392-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa Infraestrutura - Pequeno Médio Porte
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2024
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2027
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Luiz Lehmann Coutinho
• Beneficiário: Luiz Lehmann Coutinho
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Aline Silva Mello Cesar ; Roberto Sartori Filho
• Assunto(s): Biologia celular Genômica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: biologia celular | Genômica | Variação Funcional | Genômica

Resumo

O Centro de Genômica Funcional da ESALQ tem atendido pesquisadores de Universidade, Embrapa, Institutos de pesquisa, empresas do setor privado. Ao longo dos últimos 5 anos atendemos 337 projetos de genômica de 79 instituições do Brasil e do exterior. Entre as instituições atendidos encontramos diversas Universidades Estaduais, Universidade Federais, Institutos de pesquisa, 12 unidades da Embrapa, Fiocruz, Butantan, Universidade de Duke, NC, EUA e empresas como Dupont, Souza Cruz, Pragas.com. e GDM. Neste projeto estamos solicitando a aquisição de: 1) um microscópio invertido especializado na captura e processamento de imagens de tecidos e cultura de células em campo claro e em fluorescência. Este equipamento vai permitir estudos detalhadas de genômica funcional em cultura de células. O Centro de Genômica Funcional implementou com apoio da Instituição um laboratório de cultura de tecidos para validação funcional in vitro de genes e regiões genômicas de interesse identificados por bioinformática. Para isso, utilizamos metodologias de cultura celular, de histologia, gene repórter, RNA de interferência edição gênica. Dessa forma, para visualizarmos e analisarmos as modificações realizadas nas células, faz-se necessária a obtenção de um microscópio invertido para nosso Centro. A fluorescência será utilizada para detectar moléculas inseridas nas células por transfecção e analisar modificações morfológicas e estruturais após marcação por imunoensaio. 2) Um equipamento para escaneamento de lâminas de microarranjo (iScan da Illumina). Este equipamento vai repor o HiScan, que é muito utilizado, mas já está descontinuado pela Illumina e não tem mais peças de reposição. 3) Um sequenciador Nanopore. A aquisição de um sequenciador da Nanopore vai ser de grande interesse pela comunidade de pesquisadores, pois as leituras longas contribuem muito para montagem de genoma de novo, identificação de variantes estruturais etc. (AU)