Explorando o relevo de energia de agregação da beta-amilóide

• Processo: 25/03001-5
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2025
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2027
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
• Proposta de Mobilidade: SPRINT - Projetos de pesquisa - Mobilidade
• Pesquisador responsável: Vitor Barbanti Pereira Leite
• Beneficiário: Vitor Barbanti Pereira Leite
• Pesquisador Responsável no exterior: Min-Yeh Tsai
• Instituição Parceira no exterior: National Chung Cheng University, Taiwan
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Araraquara. Araraquara , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 22/07231-7 - Plasticidade e modulação funcional de proteínas intrinsecamente desordenadas, AP.TEM
• Assunto(s): Simulação de dinâmica molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: agregação molecular | Dinâmica Molecular | Patologias neurodegenerativas | proteínas intrinsecamente desordenadas | Relevo de Energia | Enovelamento Proteínas

Resumo

A agregação de proteínas desempenha um papel crucial na patologia de doenças neurodegenerativas, particularmente na doença de Alzheimer, onde peptídeos beta-amiloides (AB) formam agregados tóxicos. Compreender os mecanismos que impulsionam a agregação de AB é essencial para o desenvolvimento de intervenções terapêuticas. Este projeto tem como objetivo investigar o relevo de energia associado à agregação de AB40 e AB42 por meio de simulações de dinâmica molecular e do Método de Visualização da Relevo de Energia (Energy Landscape Visualization Method, ELViM). O ELViM, desenvolvido na UNESP, fornece uma abordagem multidimensional para a análise de espaços conformacionais biomoleculares sem depender de coordenadas de reação ou estruturas predefinidas. Ao combinar simulações computacionais realizadas na National Chung Cheng University (CCU) com análises baseadas no ELViM, identificaremos estados conformacionais-chave, vias de agregação e determinantes estruturais que influenciam a formação de oligômeros. Essa colaboração avançará nosso entendimento sobre a agregação de proteínas intrinsecamente desordenadas e contribuirá para o desenvolvimento de novas metodologias computacionais para o estudo dos mecanismos das doenças neurodegenerativas. Além disso, este projeto fortalecerá parcerias internacionais, oferecerá oportunidades de treinamento para estudantes e estabelecerá as bases para futuras iniciativas de financiamento voltadas para doenças relacionadas a proteínas intrinsecamente desordenadas. (AU)