Pangenômica do Bacuri (Platonia insignis), o "Ouro da Amazônia": Arquitetura e Diversidade Genômico-Funcional para Impulsionar o Melhoramento de Espécies Emergentes

• Processo: 25/13660-6
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2026
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2029
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
• Pesquisador responsável: Alessandro de Mello Varani
• Beneficiário: Alessandro de Mello Varani
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
• Município da Instituição Sede: Jaboticabal
• Pesquisadores associados: Alexandre Rossi Paschoal ; Ana Paula de Moraes ; Camila Cesario Fernandes ; Douglas Silva Domingues ; Marie-Anne Van Sluys ; Rafael Moysés Alves ; Saura Rodrigues da Silva ; Vinicius Augusto Carvalho de Abreu ; Vitor Fernandes Oliveira de Miranda
• Assunto(s): Clusiaceae Genômica comparativa
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bioeconomia Amazônica | Clusiaceae | genômica comparativa | Neofuncionalização | Paleopoliploidia | pangenoma | Genômica, Bioinformática, Genômica Comparativa, Biologia de Sistemas

Resumo

A genômica de plantas avançou rapidamente com o barateamento do sequenciamento de novageração e, mais recentemente, com tecnologias como PacBio HiFi, ONT ultralong e Hi-C, queviabilizam montagens telômero-a-telômero (T2T) e pangenomas. Grupos internacionais já vêmpublicando genomas T2T de espécies da biodiversidade amazônica - muitas vezes semparticipação de cientistas brasileiros -, enquanto o Brasil ainda busca consolidar seuprotagonismo nessa fronteira. Um exemplo é o bacurizeiro (Platonia insignis Mart.), cuja polpapossui elevado valor agregado (até 3,5 vezes o preço do cupuaçu), mas ainda carece de recursosgenômicos que sustentem seu melhoramento. Seu ciclo produtivo é superior a dez anos,refletindo uma longa fase juvenil que posterga avaliações fenotípicas e genéticas. Apesar daseleção de clones-elite com elevado rendimento e precocidade de frutificação, a espécie seguenegligenciada na genômica, limitada a estudos de marcadores e genética de populações. Com umgenoma estimado em ¿13 Gb, provável poliploidia e alta densidade de elementos transponíveis,P. insignis representa um desafio técnico e uma oportunidade científica para a genômica tropical.Partimos da hipótese de que a variabilidade estrutural e de sequência entre clones-elite eindivíduos silvestres não apenas explica diferenças em rendimento e frutificação, mas tambémreflete eventos de duplicação genômica, subfuncionalização e neofuncionalização de famíliasgênicas associadas ao desenvolvimento do fruto e à adaptação a estresses bióticos e abióticos -lacunas críticas na genética de espécies tropicais. Para preencher essas carências, impulsionar abioeconomia amazônica e avançar o conhecimento, propomos gerar o primeiro genoma dereferência T2T da família Clusiaceae (a partir de um clone-elite de P. insignis a ser lançado),integrando PacBio HiFi, ONT ultralongas e Hi-C. Também construiremos um pangenomamulticlone, dissecando a estrutura e evolução de famílias gênicas de interesse (incluindoduplicações ancestrais e adaptações funcionais), identificaremos genes sob seleção positiva emapearemos variantes estruturais e SNPs possivelmente associados a traços agronômicos. Emparalelo, definiremos genes-alvo para seleção assistida. Todos os dados serão disponibilizadosconforme os princípios FAIR e as diretrizes do SisGen. Além de representar um avanço defronteira na genômica comparativa de plantas tropicais de grande porte, os recursos geradospermitirão estudos de associação em larga escala, acelerarão programas de melhoramento deciclo longo e contribuirão para consolidar o protagonismo científico do Brasil na genômicavegetal. (AU)